Protein–RNA interactions for Protein: Q99626

CDX2, Homeobox protein CDX-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 313 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDX2Q99626 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CDX2Q99626 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CDX2Q99626 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CDX2Q99626 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CDX2Q99626 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CDX2Q99626 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CDX2Q99626 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
CDX2Q99626 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CDX2Q99626 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CDX2Q99626 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CDX2Q99626 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CDX2Q99626 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CDX2Q99626 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CDX2Q99626 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CDX2Q99626 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CDX2Q99626 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
CDX2Q99626 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CDX2Q99626 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CDX2Q99626 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CDX2Q99626 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CDX2Q99626 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
CDX2Q99626 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
CDX2Q99626 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
CDX2Q99626 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CDX2Q99626 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CDX2Q99626 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CDX2Q99626 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CDX2Q99626 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CDX2Q99626 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CDX2Q99626 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CDX2Q99626 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CDX2Q99626 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CDX2Q99626 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CDX2Q99626 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CDX2Q99626 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CDX2Q99626 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CDX2Q99626 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CDX2Q99626 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CDX2Q99626 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CDX2Q99626 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CDX2Q99626 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CDX2Q99626 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CDX2Q99626 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CDX2Q99626 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CDX2Q99626 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CDX2Q99626 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CDX2Q99626 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CDX2Q99626 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CDX2Q99626 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CDX2Q99626 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CDX2Q99626 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CDX2Q99626 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC28■■■□□ 2.07
CDX2Q99626 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CDX2Q99626 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
CDX2Q99626 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC28■■■□□ 2.07
CDX2Q99626 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CDX2Q99626 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CDX2Q99626 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CDX2Q99626 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CDX2Q99626 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CDX2Q99626 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CDX2Q99626 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CDX2Q99626 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CDX2Q99626 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CDX2Q99626 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CDX2Q99626 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CDX2Q99626 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CDX2Q99626 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
CDX2Q99626 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CDX2Q99626 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
CDX2Q99626 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
CDX2Q99626 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
CDX2Q99626 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
CDX2Q99626 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
CDX2Q99626 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CDX2Q99626 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
CDX2Q99626 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CDX2Q99626 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CDX2Q99626 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CDX2Q99626 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
CDX2Q99626 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CDX2Q99626 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CDX2Q99626 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CDX2Q99626 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CDX2Q99626 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CDX2Q99626 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CDX2Q99626 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
CDX2Q99626 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC27.89■■■□□ 2.05
CDX2Q99626 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
CDX2Q99626 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CDX2Q99626 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CDX2Q99626 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CDX2Q99626 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CDX2Q99626 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
CDX2Q99626 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CDX2Q99626 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CDX2Q99626 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CDX2Q99626 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CDX2Q99626 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CDX2Q99626 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms