Protein–RNA interactions for Protein: Q99062

CSF3R, Granulocyte colony-stimulating factor receptor, humanhuman

Predictions only

Length 836 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSF3RQ99062 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CSF3RQ99062 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CSF3RQ99062 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CSF3RQ99062 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CSF3RQ99062 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CSF3RQ99062 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CSF3RQ99062 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CSF3RQ99062 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CSF3RQ99062 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CSF3RQ99062 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CSF3RQ99062 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
CSF3RQ99062 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CSF3RQ99062 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CSF3RQ99062 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CSF3RQ99062 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CSF3RQ99062 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
CSF3RQ99062 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CSF3RQ99062 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CSF3RQ99062 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CSF3RQ99062 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CSF3RQ99062 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
CSF3RQ99062 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CSF3RQ99062 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CSF3RQ99062 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CSF3RQ99062 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CSF3RQ99062 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CSF3RQ99062 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CSF3RQ99062 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CSF3RQ99062 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CSF3RQ99062 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CSF3RQ99062 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CSF3RQ99062 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CSF3RQ99062 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CSF3RQ99062 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CSF3RQ99062 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CSF3RQ99062 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CSF3RQ99062 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CSF3RQ99062 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CSF3RQ99062 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CSF3RQ99062 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CSF3RQ99062 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CSF3RQ99062 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CSF3RQ99062 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CSF3RQ99062 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CSF3RQ99062 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
CSF3RQ99062 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CSF3RQ99062 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CSF3RQ99062 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CSF3RQ99062 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CSF3RQ99062 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CSF3RQ99062 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CSF3RQ99062 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CSF3RQ99062 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
CSF3RQ99062 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CSF3RQ99062 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CSF3RQ99062 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CSF3RQ99062 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CSF3RQ99062 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CSF3RQ99062 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CSF3RQ99062 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CSF3RQ99062 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CSF3RQ99062 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CSF3RQ99062 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CSF3RQ99062 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CSF3RQ99062 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CSF3RQ99062 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CSF3RQ99062 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CSF3RQ99062 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CSF3RQ99062 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CSF3RQ99062 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CSF3RQ99062 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CSF3RQ99062 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CSF3RQ99062 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CSF3RQ99062 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CSF3RQ99062 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CSF3RQ99062 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CSF3RQ99062 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CSF3RQ99062 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CSF3RQ99062 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CSF3RQ99062 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CSF3RQ99062 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CSF3RQ99062 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CSF3RQ99062 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CSF3RQ99062 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CSF3RQ99062 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CSF3RQ99062 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
CSF3RQ99062 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
CSF3RQ99062 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CSF3RQ99062 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CSF3RQ99062 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CSF3RQ99062 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CSF3RQ99062 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CSF3RQ99062 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CSF3RQ99062 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
CSF3RQ99062 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.45■■□□□ 1.51
CSF3RQ99062 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CSF3RQ99062 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CSF3RQ99062 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
CSF3RQ99062 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CSF3RQ99062 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms