Protein–RNA interactions for Protein: Q96T68

SETDB2, Histone-lysine N-methyltransferase SETDB2, humanhuman

Predictions only

Length 719 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SETDB2Q96T68 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
SETDB2Q96T68 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC33.09■■■□□ 2.89
SETDB2Q96T68 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.09■■■□□ 2.89
SETDB2Q96T68 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
SETDB2Q96T68 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
SETDB2Q96T68 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC33.07■■■□□ 2.88
SETDB2Q96T68 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
SETDB2Q96T68 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
SETDB2Q96T68 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC33.04■■■□□ 2.88
SETDB2Q96T68 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC33.04■■■□□ 2.88
SETDB2Q96T68 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
SETDB2Q96T68 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC33.02■■■□□ 2.88
SETDB2Q96T68 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC33.02■■■□□ 2.88
SETDB2Q96T68 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
SETDB2Q96T68 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
SETDB2Q96T68 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC33.01■■■□□ 2.88
SETDB2Q96T68 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
SETDB2Q96T68 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC33.01■■■□□ 2.87
SETDB2Q96T68 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC33■■■□□ 2.87
SETDB2Q96T68 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
SETDB2Q96T68 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC32.99■■■□□ 2.87
SETDB2Q96T68 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC32.99■■■□□ 2.87
SETDB2Q96T68 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
SETDB2Q96T68 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
SETDB2Q96T68 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC32.98■■■□□ 2.87
SETDB2Q96T68 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
SETDB2Q96T68 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
SETDB2Q96T68 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.97■■■□□ 2.87
SETDB2Q96T68 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC32.97■■■□□ 2.87
SETDB2Q96T68 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
SETDB2Q96T68 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC32.96■■■□□ 2.87
SETDB2Q96T68 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
SETDB2Q96T68 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.94■■■□□ 2.86
SETDB2Q96T68 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC32.94■■■□□ 2.86
SETDB2Q96T68 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC32.93■■■□□ 2.86
SETDB2Q96T68 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
SETDB2Q96T68 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC32.92■■■□□ 2.86
SETDB2Q96T68 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.92■■■□□ 2.86
SETDB2Q96T68 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
SETDB2Q96T68 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC32.91■■■□□ 2.86
SETDB2Q96T68 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC32.91■■■□□ 2.86
SETDB2Q96T68 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
SETDB2Q96T68 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC32.9■■■□□ 2.86
SETDB2Q96T68 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC32.9■■■□□ 2.86
SETDB2Q96T68 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
SETDB2Q96T68 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
SETDB2Q96T68 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.89■■■□□ 2.86
SETDB2Q96T68 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
SETDB2Q96T68 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.88■■■□□ 2.85
SETDB2Q96T68 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
SETDB2Q96T68 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.88■■■□□ 2.85
SETDB2Q96T68 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC32.87■■■□□ 2.85
SETDB2Q96T68 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
SETDB2Q96T68 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
SETDB2Q96T68 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.85■■■□□ 2.85
SETDB2Q96T68 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
SETDB2Q96T68 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
SETDB2Q96T68 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
SETDB2Q96T68 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
SETDB2Q96T68 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.82■■■□□ 2.84
SETDB2Q96T68 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.82■■■□□ 2.84
SETDB2Q96T68 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC32.81■■■□□ 2.84
SETDB2Q96T68 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC32.8■■■□□ 2.84
SETDB2Q96T68 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC32.79■■■□□ 2.84
SETDB2Q96T68 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC32.78■■■□□ 2.84
SETDB2Q96T68 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
SETDB2Q96T68 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
SETDB2Q96T68 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
SETDB2Q96T68 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.77■■■□□ 2.84
SETDB2Q96T68 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC32.77■■■□□ 2.84
SETDB2Q96T68 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
SETDB2Q96T68 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
SETDB2Q96T68 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
SETDB2Q96T68 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC32.75■■■□□ 2.83
SETDB2Q96T68 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC32.75■■■□□ 2.83
SETDB2Q96T68 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC32.74■■■□□ 2.83
SETDB2Q96T68 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
SETDB2Q96T68 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
SETDB2Q96T68 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
SETDB2Q96T68 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
SETDB2Q96T68 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC32.72■■■□□ 2.83
SETDB2Q96T68 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC32.72■■■□□ 2.83
SETDB2Q96T68 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.72■■■□□ 2.83
SETDB2Q96T68 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
SETDB2Q96T68 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
SETDB2Q96T68 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
SETDB2Q96T68 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
SETDB2Q96T68 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
SETDB2Q96T68 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
SETDB2Q96T68 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
SETDB2Q96T68 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
SETDB2Q96T68 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
SETDB2Q96T68 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC32.67■■■□□ 2.82
SETDB2Q96T68 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC32.67■■■□□ 2.82
SETDB2Q96T68 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
SETDB2Q96T68 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC32.66■■■□□ 2.82
SETDB2Q96T68 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
SETDB2Q96T68 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
SETDB2Q96T68 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
SETDB2Q96T68 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50 ms