Protein–RNA interactions for Protein: Q96RT6

CTAGE1, cTAGE family member 2, humanhuman

Predictions only

Length 745 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTAGE1Q96RT6 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
CTAGE1Q96RT6 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
CTAGE1Q96RT6 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
CTAGE1Q96RT6 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
CTAGE1Q96RT6 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
CTAGE1Q96RT6 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
CTAGE1Q96RT6 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
CTAGE1Q96RT6 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
CTAGE1Q96RT6 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC29.58■■■□□ 2.33
CTAGE1Q96RT6 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
CTAGE1Q96RT6 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
CTAGE1Q96RT6 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
CTAGE1Q96RT6 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.56■■■□□ 2.32
CTAGE1Q96RT6 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
CTAGE1Q96RT6 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
CTAGE1Q96RT6 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
CTAGE1Q96RT6 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
CTAGE1Q96RT6 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
CTAGE1Q96RT6 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
CTAGE1Q96RT6 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
CTAGE1Q96RT6 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
CTAGE1Q96RT6 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
CTAGE1Q96RT6 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
CTAGE1Q96RT6 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
CTAGE1Q96RT6 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
CTAGE1Q96RT6 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
CTAGE1Q96RT6 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
CTAGE1Q96RT6 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
CTAGE1Q96RT6 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
CTAGE1Q96RT6 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
CTAGE1Q96RT6 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
CTAGE1Q96RT6 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
CTAGE1Q96RT6 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
CTAGE1Q96RT6 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
CTAGE1Q96RT6 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
CTAGE1Q96RT6 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
CTAGE1Q96RT6 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
CTAGE1Q96RT6 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
CTAGE1Q96RT6 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
CTAGE1Q96RT6 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
CTAGE1Q96RT6 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
CTAGE1Q96RT6 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
CTAGE1Q96RT6 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
CTAGE1Q96RT6 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
CTAGE1Q96RT6 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC29.43■■■□□ 2.3
CTAGE1Q96RT6 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
CTAGE1Q96RT6 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
CTAGE1Q96RT6 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
CTAGE1Q96RT6 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
CTAGE1Q96RT6 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
CTAGE1Q96RT6 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
CTAGE1Q96RT6 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
CTAGE1Q96RT6 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC29.41■■■□□ 2.3
CTAGE1Q96RT6 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC29.4■■■□□ 2.3
CTAGE1Q96RT6 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
CTAGE1Q96RT6 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
CTAGE1Q96RT6 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
CTAGE1Q96RT6 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC29.39■■■□□ 2.3
CTAGE1Q96RT6 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
CTAGE1Q96RT6 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC29.38■■■□□ 2.29
CTAGE1Q96RT6 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC29.38■■■□□ 2.29
CTAGE1Q96RT6 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
CTAGE1Q96RT6 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
CTAGE1Q96RT6 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
CTAGE1Q96RT6 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
CTAGE1Q96RT6 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
CTAGE1Q96RT6 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
CTAGE1Q96RT6 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
CTAGE1Q96RT6 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
CTAGE1Q96RT6 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
CTAGE1Q96RT6 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
CTAGE1Q96RT6 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
CTAGE1Q96RT6 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
CTAGE1Q96RT6 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC29.35■■■□□ 2.29
CTAGE1Q96RT6 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
CTAGE1Q96RT6 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
CTAGE1Q96RT6 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
CTAGE1Q96RT6 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
CTAGE1Q96RT6 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
CTAGE1Q96RT6 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
CTAGE1Q96RT6 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC29.33■■■□□ 2.29
CTAGE1Q96RT6 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
CTAGE1Q96RT6 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
CTAGE1Q96RT6 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
CTAGE1Q96RT6 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
CTAGE1Q96RT6 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
CTAGE1Q96RT6 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
CTAGE1Q96RT6 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC29.31■■■□□ 2.28
CTAGE1Q96RT6 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
CTAGE1Q96RT6 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
CTAGE1Q96RT6 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
CTAGE1Q96RT6 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
CTAGE1Q96RT6 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
CTAGE1Q96RT6 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
CTAGE1Q96RT6 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
CTAGE1Q96RT6 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
CTAGE1Q96RT6 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
CTAGE1Q96RT6 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
CTAGE1Q96RT6 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
CTAGE1Q96RT6 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 96.6 ms