Protein–RNA interactions for Protein: Q96QP1

ALPK1, Alpha-protein kinase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALPK1Q96QP1 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ALPK1Q96QP1 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ALPK1Q96QP1 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ALPK1Q96QP1 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ALPK1Q96QP1 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ALPK1Q96QP1 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ALPK1Q96QP1 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ALPK1Q96QP1 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ALPK1Q96QP1 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ALPK1Q96QP1 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ALPK1Q96QP1 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ALPK1Q96QP1 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ALPK1Q96QP1 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ALPK1Q96QP1 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ALPK1Q96QP1 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ALPK1Q96QP1 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ALPK1Q96QP1 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
ALPK1Q96QP1 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ALPK1Q96QP1 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ALPK1Q96QP1 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ALPK1Q96QP1 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ALPK1Q96QP1 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ALPK1Q96QP1 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ALPK1Q96QP1 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ALPK1Q96QP1 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ALPK1Q96QP1 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
ALPK1Q96QP1 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ALPK1Q96QP1 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
ALPK1Q96QP1 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ALPK1Q96QP1 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
ALPK1Q96QP1 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ALPK1Q96QP1 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ALPK1Q96QP1 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ALPK1Q96QP1 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ALPK1Q96QP1 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ALPK1Q96QP1 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ALPK1Q96QP1 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ALPK1Q96QP1 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ALPK1Q96QP1 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ALPK1Q96QP1 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
ALPK1Q96QP1 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ALPK1Q96QP1 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ALPK1Q96QP1 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ALPK1Q96QP1 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ALPK1Q96QP1 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ALPK1Q96QP1 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ALPK1Q96QP1 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ALPK1Q96QP1 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ALPK1Q96QP1 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ALPK1Q96QP1 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ALPK1Q96QP1 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ALPK1Q96QP1 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ALPK1Q96QP1 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC24■■□□□ 1.43
ALPK1Q96QP1 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ALPK1Q96QP1 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ALPK1Q96QP1 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ALPK1Q96QP1 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ALPK1Q96QP1 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
ALPK1Q96QP1 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
ALPK1Q96QP1 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ALPK1Q96QP1 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ALPK1Q96QP1 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ALPK1Q96QP1 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ALPK1Q96QP1 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ALPK1Q96QP1 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ALPK1Q96QP1 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ALPK1Q96QP1 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ALPK1Q96QP1 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ALPK1Q96QP1 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ALPK1Q96QP1 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ALPK1Q96QP1 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ALPK1Q96QP1 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ALPK1Q96QP1 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ALPK1Q96QP1 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ALPK1Q96QP1 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ALPK1Q96QP1 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ALPK1Q96QP1 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ALPK1Q96QP1 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ALPK1Q96QP1 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ALPK1Q96QP1 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ALPK1Q96QP1 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ALPK1Q96QP1 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ALPK1Q96QP1 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ALPK1Q96QP1 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ALPK1Q96QP1 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ALPK1Q96QP1 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ALPK1Q96QP1 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ALPK1Q96QP1 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ALPK1Q96QP1 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ALPK1Q96QP1 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ALPK1Q96QP1 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ALPK1Q96QP1 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ALPK1Q96QP1 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ALPK1Q96QP1 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ALPK1Q96QP1 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ALPK1Q96QP1 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ALPK1Q96QP1 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ALPK1Q96QP1 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ALPK1Q96QP1 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ALPK1Q96QP1 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 368 ms