Protein–RNA interactions for Protein: Q96PQ0

SORCS2, VPS10 domain-containing receptor SorCS2, humanhuman

Predictions only

Length 1,159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SORCS2Q96PQ0 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SORCS2Q96PQ0 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SORCS2Q96PQ0 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SORCS2Q96PQ0 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SORCS2Q96PQ0 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SORCS2Q96PQ0 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SORCS2Q96PQ0 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SORCS2Q96PQ0 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SORCS2Q96PQ0 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SORCS2Q96PQ0 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SORCS2Q96PQ0 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SORCS2Q96PQ0 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SORCS2Q96PQ0 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SORCS2Q96PQ0 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SORCS2Q96PQ0 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SORCS2Q96PQ0 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SORCS2Q96PQ0 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SORCS2Q96PQ0 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SORCS2Q96PQ0 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SORCS2Q96PQ0 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SORCS2Q96PQ0 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SORCS2Q96PQ0 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SORCS2Q96PQ0 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SORCS2Q96PQ0 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SORCS2Q96PQ0 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SORCS2Q96PQ0 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SORCS2Q96PQ0 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SORCS2Q96PQ0 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SORCS2Q96PQ0 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SORCS2Q96PQ0 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
SORCS2Q96PQ0 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SORCS2Q96PQ0 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SORCS2Q96PQ0 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SORCS2Q96PQ0 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SORCS2Q96PQ0 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SORCS2Q96PQ0 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SORCS2Q96PQ0 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SORCS2Q96PQ0 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SORCS2Q96PQ0 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SORCS2Q96PQ0 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
SORCS2Q96PQ0 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SORCS2Q96PQ0 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SORCS2Q96PQ0 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SORCS2Q96PQ0 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SORCS2Q96PQ0 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SORCS2Q96PQ0 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SORCS2Q96PQ0 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SORCS2Q96PQ0 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SORCS2Q96PQ0 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SORCS2Q96PQ0 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SORCS2Q96PQ0 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SORCS2Q96PQ0 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SORCS2Q96PQ0 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SORCS2Q96PQ0 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SORCS2Q96PQ0 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SORCS2Q96PQ0 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SORCS2Q96PQ0 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SORCS2Q96PQ0 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
SORCS2Q96PQ0 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SORCS2Q96PQ0 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SORCS2Q96PQ0 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SORCS2Q96PQ0 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SORCS2Q96PQ0 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SORCS2Q96PQ0 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SORCS2Q96PQ0 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
SORCS2Q96PQ0 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SORCS2Q96PQ0 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SORCS2Q96PQ0 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SORCS2Q96PQ0 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SORCS2Q96PQ0 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SORCS2Q96PQ0 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SORCS2Q96PQ0 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SORCS2Q96PQ0 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SORCS2Q96PQ0 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SORCS2Q96PQ0 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SORCS2Q96PQ0 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SORCS2Q96PQ0 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SORCS2Q96PQ0 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SORCS2Q96PQ0 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SORCS2Q96PQ0 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SORCS2Q96PQ0 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SORCS2Q96PQ0 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SORCS2Q96PQ0 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SORCS2Q96PQ0 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SORCS2Q96PQ0 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SORCS2Q96PQ0 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SORCS2Q96PQ0 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SORCS2Q96PQ0 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SORCS2Q96PQ0 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SORCS2Q96PQ0 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SORCS2Q96PQ0 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SORCS2Q96PQ0 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
SORCS2Q96PQ0 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SORCS2Q96PQ0 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SORCS2Q96PQ0 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SORCS2Q96PQ0 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SORCS2Q96PQ0 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SORCS2Q96PQ0 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SORCS2Q96PQ0 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SORCS2Q96PQ0 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.3 ms