Protein–RNA interactions for Protein: Q96PE3

INPP4A, Type I inositol 3,4-bisphosphate 4-phosphatase, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 977 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
INPP4AQ96PE3 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC29.56■■■□□ 2.32
INPP4AQ96PE3 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
INPP4AQ96PE3 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
INPP4AQ96PE3 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC29.54■■■□□ 2.32
INPP4AQ96PE3 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
INPP4AQ96PE3 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
INPP4AQ96PE3 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
INPP4AQ96PE3 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC29.53■■■□□ 2.32
INPP4AQ96PE3 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
INPP4AQ96PE3 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
INPP4AQ96PE3 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
INPP4AQ96PE3 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
INPP4AQ96PE3 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
INPP4AQ96PE3 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
INPP4AQ96PE3 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
INPP4AQ96PE3 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
INPP4AQ96PE3 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.32
INPP4AQ96PE3 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
INPP4AQ96PE3 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
INPP4AQ96PE3 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC29.51■■■□□ 2.31
INPP4AQ96PE3 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
INPP4AQ96PE3 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
INPP4AQ96PE3 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
INPP4AQ96PE3 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
INPP4AQ96PE3 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
INPP4AQ96PE3 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
INPP4AQ96PE3 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC29.49■■■□□ 2.31
INPP4AQ96PE3 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
INPP4AQ96PE3 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
INPP4AQ96PE3 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
INPP4AQ96PE3 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
INPP4AQ96PE3 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
INPP4AQ96PE3 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
INPP4AQ96PE3 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
INPP4AQ96PE3 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
INPP4AQ96PE3 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
INPP4AQ96PE3 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
INPP4AQ96PE3 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
INPP4AQ96PE3 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
INPP4AQ96PE3 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
INPP4AQ96PE3 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
INPP4AQ96PE3 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
INPP4AQ96PE3 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
INPP4AQ96PE3 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
INPP4AQ96PE3 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC29.47■■■□□ 2.31
INPP4AQ96PE3 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
INPP4AQ96PE3 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
INPP4AQ96PE3 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
INPP4AQ96PE3 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
INPP4AQ96PE3 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
INPP4AQ96PE3 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
INPP4AQ96PE3 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
INPP4AQ96PE3 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
INPP4AQ96PE3 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
INPP4AQ96PE3 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
INPP4AQ96PE3 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
INPP4AQ96PE3 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
INPP4AQ96PE3 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC29.42■■■□□ 2.3
INPP4AQ96PE3 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
INPP4AQ96PE3 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
INPP4AQ96PE3 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC29.41■■■□□ 2.3
INPP4AQ96PE3 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
INPP4AQ96PE3 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
INPP4AQ96PE3 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
INPP4AQ96PE3 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
INPP4AQ96PE3 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
INPP4AQ96PE3 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
INPP4AQ96PE3 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
INPP4AQ96PE3 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
INPP4AQ96PE3 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
INPP4AQ96PE3 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
INPP4AQ96PE3 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
INPP4AQ96PE3 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
INPP4AQ96PE3 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
INPP4AQ96PE3 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
INPP4AQ96PE3 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
INPP4AQ96PE3 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
INPP4AQ96PE3 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
INPP4AQ96PE3 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
INPP4AQ96PE3 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
INPP4AQ96PE3 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
INPP4AQ96PE3 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
INPP4AQ96PE3 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
INPP4AQ96PE3 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
INPP4AQ96PE3 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
INPP4AQ96PE3 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
INPP4AQ96PE3 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
INPP4AQ96PE3 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
INPP4AQ96PE3 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
INPP4AQ96PE3 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.28■■■□□ 2.28
INPP4AQ96PE3 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
INPP4AQ96PE3 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
INPP4AQ96PE3 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
INPP4AQ96PE3 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
INPP4AQ96PE3 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
INPP4AQ96PE3 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
INPP4AQ96PE3 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
INPP4AQ96PE3 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
INPP4AQ96PE3 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC29.24■■■□□ 2.27
INPP4AQ96PE3 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 96.1 ms