Protein–RNA interactions for Protein: Q96P16

RPRD1A, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 1A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 312 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPRD1AQ96P16 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
RPRD1AQ96P16 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
RPRD1AQ96P16 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
RPRD1AQ96P16 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
RPRD1AQ96P16 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC26.81■■□□□ 1.88
RPRD1AQ96P16 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
RPRD1AQ96P16 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
RPRD1AQ96P16 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
RPRD1AQ96P16 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
RPRD1AQ96P16 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
RPRD1AQ96P16 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
RPRD1AQ96P16 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
RPRD1AQ96P16 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
RPRD1AQ96P16 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
RPRD1AQ96P16 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
RPRD1AQ96P16 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
RPRD1AQ96P16 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC26.75■■□□□ 1.87
RPRD1AQ96P16 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
RPRD1AQ96P16 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
RPRD1AQ96P16 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
RPRD1AQ96P16 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
RPRD1AQ96P16 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
RPRD1AQ96P16 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
RPRD1AQ96P16 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
RPRD1AQ96P16 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
RPRD1AQ96P16 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
RPRD1AQ96P16 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
RPRD1AQ96P16 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC26.73■■□□□ 1.87
RPRD1AQ96P16 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
RPRD1AQ96P16 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC26.73■■□□□ 1.87
RPRD1AQ96P16 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
RPRD1AQ96P16 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
RPRD1AQ96P16 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
RPRD1AQ96P16 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
RPRD1AQ96P16 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
RPRD1AQ96P16 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
RPRD1AQ96P16 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
RPRD1AQ96P16 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
RPRD1AQ96P16 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
RPRD1AQ96P16 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.86
RPRD1AQ96P16 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
RPRD1AQ96P16 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
RPRD1AQ96P16 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
RPRD1AQ96P16 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
RPRD1AQ96P16 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
RPRD1AQ96P16 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
RPRD1AQ96P16 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
RPRD1AQ96P16 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
RPRD1AQ96P16 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
RPRD1AQ96P16 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
RPRD1AQ96P16 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
RPRD1AQ96P16 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
RPRD1AQ96P16 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
RPRD1AQ96P16 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
RPRD1AQ96P16 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
RPRD1AQ96P16 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
RPRD1AQ96P16 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
RPRD1AQ96P16 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
RPRD1AQ96P16 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
RPRD1AQ96P16 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
RPRD1AQ96P16 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC26.64■■□□□ 1.86
RPRD1AQ96P16 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
RPRD1AQ96P16 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
RPRD1AQ96P16 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
RPRD1AQ96P16 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
RPRD1AQ96P16 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
RPRD1AQ96P16 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
RPRD1AQ96P16 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
RPRD1AQ96P16 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
RPRD1AQ96P16 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
RPRD1AQ96P16 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
RPRD1AQ96P16 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
RPRD1AQ96P16 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
RPRD1AQ96P16 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
RPRD1AQ96P16 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
RPRD1AQ96P16 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
RPRD1AQ96P16 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
RPRD1AQ96P16 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
RPRD1AQ96P16 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
RPRD1AQ96P16 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
RPRD1AQ96P16 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
RPRD1AQ96P16 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
RPRD1AQ96P16 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
RPRD1AQ96P16 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
RPRD1AQ96P16 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
RPRD1AQ96P16 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
RPRD1AQ96P16 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
RPRD1AQ96P16 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
RPRD1AQ96P16 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
RPRD1AQ96P16 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
RPRD1AQ96P16 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
RPRD1AQ96P16 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
RPRD1AQ96P16 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
RPRD1AQ96P16 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
RPRD1AQ96P16 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
RPRD1AQ96P16 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
RPRD1AQ96P16 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
RPRD1AQ96P16 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
RPRD1AQ96P16 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
RPRD1AQ96P16 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.4 ms