Protein–RNA interactions for Protein: Q96NU0

CNTNAP3B, Contactin-associated protein-like 3B, humanhuman

Predictions only

Length 1,288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTNAP3BQ96NU0 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CNTNAP3BQ96NU0 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CNTNAP3BQ96NU0 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CNTNAP3BQ96NU0 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CNTNAP3BQ96NU0 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CNTNAP3BQ96NU0 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CNTNAP3BQ96NU0 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CNTNAP3BQ96NU0 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CNTNAP3BQ96NU0 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CNTNAP3BQ96NU0 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CNTNAP3BQ96NU0 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CNTNAP3BQ96NU0 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CNTNAP3BQ96NU0 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CNTNAP3BQ96NU0 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CNTNAP3BQ96NU0 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
CNTNAP3BQ96NU0 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CNTNAP3BQ96NU0 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CNTNAP3BQ96NU0 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CNTNAP3BQ96NU0 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CNTNAP3BQ96NU0 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CNTNAP3BQ96NU0 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CNTNAP3BQ96NU0 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CNTNAP3BQ96NU0 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CNTNAP3BQ96NU0 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CNTNAP3BQ96NU0 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CNTNAP3BQ96NU0 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CNTNAP3BQ96NU0 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CNTNAP3BQ96NU0 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CNTNAP3BQ96NU0 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CNTNAP3BQ96NU0 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CNTNAP3BQ96NU0 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CNTNAP3BQ96NU0 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CNTNAP3BQ96NU0 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CNTNAP3BQ96NU0 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CNTNAP3BQ96NU0 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CNTNAP3BQ96NU0 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CNTNAP3BQ96NU0 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CNTNAP3BQ96NU0 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CNTNAP3BQ96NU0 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CNTNAP3BQ96NU0 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
CNTNAP3BQ96NU0 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CNTNAP3BQ96NU0 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CNTNAP3BQ96NU0 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CNTNAP3BQ96NU0 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CNTNAP3BQ96NU0 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CNTNAP3BQ96NU0 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CNTNAP3BQ96NU0 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CNTNAP3BQ96NU0 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CNTNAP3BQ96NU0 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CNTNAP3BQ96NU0 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CNTNAP3BQ96NU0 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CNTNAP3BQ96NU0 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
CNTNAP3BQ96NU0 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CNTNAP3BQ96NU0 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CNTNAP3BQ96NU0 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
CNTNAP3BQ96NU0 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CNTNAP3BQ96NU0 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CNTNAP3BQ96NU0 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CNTNAP3BQ96NU0 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CNTNAP3BQ96NU0 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CNTNAP3BQ96NU0 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CNTNAP3BQ96NU0 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CNTNAP3BQ96NU0 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CNTNAP3BQ96NU0 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CNTNAP3BQ96NU0 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CNTNAP3BQ96NU0 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CNTNAP3BQ96NU0 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CNTNAP3BQ96NU0 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CNTNAP3BQ96NU0 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CNTNAP3BQ96NU0 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CNTNAP3BQ96NU0 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CNTNAP3BQ96NU0 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CNTNAP3BQ96NU0 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CNTNAP3BQ96NU0 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CNTNAP3BQ96NU0 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CNTNAP3BQ96NU0 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CNTNAP3BQ96NU0 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
CNTNAP3BQ96NU0 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CNTNAP3BQ96NU0 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CNTNAP3BQ96NU0 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CNTNAP3BQ96NU0 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CNTNAP3BQ96NU0 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CNTNAP3BQ96NU0 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CNTNAP3BQ96NU0 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
CNTNAP3BQ96NU0 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CNTNAP3BQ96NU0 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CNTNAP3BQ96NU0 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CNTNAP3BQ96NU0 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CNTNAP3BQ96NU0 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CNTNAP3BQ96NU0 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CNTNAP3BQ96NU0 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CNTNAP3BQ96NU0 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CNTNAP3BQ96NU0 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CNTNAP3BQ96NU0 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CNTNAP3BQ96NU0 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CNTNAP3BQ96NU0 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
CNTNAP3BQ96NU0 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CNTNAP3BQ96NU0 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CNTNAP3BQ96NU0 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CNTNAP3BQ96NU0 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.8 ms