Protein–RNA interactions for Protein: Q96NL6

SCLT1, Sodium channel and clathrin linker 1, humanhuman

Predictions only

Length 688 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCLT1Q96NL6 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
SCLT1Q96NL6 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC28.83■■■□□ 2.21
SCLT1Q96NL6 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
SCLT1Q96NL6 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
SCLT1Q96NL6 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
SCLT1Q96NL6 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
SCLT1Q96NL6 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
SCLT1Q96NL6 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
SCLT1Q96NL6 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC28.81■■■□□ 2.2
SCLT1Q96NL6 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
SCLT1Q96NL6 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
SCLT1Q96NL6 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
SCLT1Q96NL6 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC28.79■■■□□ 2.2
SCLT1Q96NL6 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
SCLT1Q96NL6 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
SCLT1Q96NL6 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
SCLT1Q96NL6 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
SCLT1Q96NL6 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
SCLT1Q96NL6 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
SCLT1Q96NL6 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
SCLT1Q96NL6 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
SCLT1Q96NL6 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
SCLT1Q96NL6 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
SCLT1Q96NL6 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
SCLT1Q96NL6 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
SCLT1Q96NL6 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
SCLT1Q96NL6 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
SCLT1Q96NL6 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
SCLT1Q96NL6 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
SCLT1Q96NL6 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
SCLT1Q96NL6 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC28.73■■■□□ 2.19
SCLT1Q96NL6 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
SCLT1Q96NL6 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
SCLT1Q96NL6 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
SCLT1Q96NL6 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
SCLT1Q96NL6 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
SCLT1Q96NL6 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.19
SCLT1Q96NL6 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC28.7■■■□□ 2.19
SCLT1Q96NL6 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
SCLT1Q96NL6 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
SCLT1Q96NL6 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
SCLT1Q96NL6 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.7■■■□□ 2.18
SCLT1Q96NL6 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
SCLT1Q96NL6 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
SCLT1Q96NL6 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
SCLT1Q96NL6 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
SCLT1Q96NL6 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
SCLT1Q96NL6 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
SCLT1Q96NL6 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
SCLT1Q96NL6 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
SCLT1Q96NL6 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
SCLT1Q96NL6 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
SCLT1Q96NL6 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
SCLT1Q96NL6 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
SCLT1Q96NL6 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
SCLT1Q96NL6 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
SCLT1Q96NL6 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
SCLT1Q96NL6 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
SCLT1Q96NL6 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
SCLT1Q96NL6 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
SCLT1Q96NL6 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
SCLT1Q96NL6 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
SCLT1Q96NL6 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
SCLT1Q96NL6 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
SCLT1Q96NL6 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
SCLT1Q96NL6 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
SCLT1Q96NL6 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
SCLT1Q96NL6 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
SCLT1Q96NL6 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
SCLT1Q96NL6 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
SCLT1Q96NL6 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
SCLT1Q96NL6 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
SCLT1Q96NL6 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
SCLT1Q96NL6 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
SCLT1Q96NL6 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
SCLT1Q96NL6 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
SCLT1Q96NL6 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
SCLT1Q96NL6 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
SCLT1Q96NL6 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
SCLT1Q96NL6 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC28.58■■■□□ 2.17
SCLT1Q96NL6 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
SCLT1Q96NL6 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.16
SCLT1Q96NL6 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
SCLT1Q96NL6 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
SCLT1Q96NL6 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
SCLT1Q96NL6 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC28.55■■■□□ 2.16
SCLT1Q96NL6 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
SCLT1Q96NL6 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
SCLT1Q96NL6 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
SCLT1Q96NL6 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
SCLT1Q96NL6 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
SCLT1Q96NL6 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
SCLT1Q96NL6 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
SCLT1Q96NL6 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
SCLT1Q96NL6 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
SCLT1Q96NL6 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
SCLT1Q96NL6 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
SCLT1Q96NL6 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
SCLT1Q96NL6 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
SCLT1Q96NL6 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.1 ms