Protein–RNA interactions for Protein: Q96MF0

Putative uncharacterized protein LOC100506887, humanhuman

Predictions only

Length 132 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q96MF0 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Q96MF0 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Q96MF0 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Q96MF0 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Q96MF0 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Q96MF0 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Q96MF0 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Q96MF0 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Q96MF0 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Q96MF0 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Q96MF0 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Q96MF0 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Q96MF0 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Q96MF0 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Q96MF0 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Q96MF0 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Q96MF0 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Q96MF0 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Q96MF0 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Q96MF0 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Q96MF0 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Q96MF0 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Q96MF0 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Q96MF0 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Q96MF0 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Q96MF0 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Q96MF0 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Q96MF0 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Q96MF0 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Q96MF0 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Q96MF0 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Q96MF0 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Q96MF0 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Q96MF0 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Q96MF0 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Q96MF0 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Q96MF0 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Q96MF0 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Q96MF0 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Q96MF0 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Q96MF0 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Q96MF0 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Q96MF0 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Q96MF0 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Q96MF0 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Q96MF0 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Q96MF0 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Q96MF0 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Q96MF0 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Q96MF0 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Q96MF0 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Q96MF0 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Q96MF0 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Q96MF0 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Q96MF0 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Q96MF0 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Q96MF0 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Q96MF0 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Q96MF0 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Q96MF0 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Q96MF0 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Q96MF0 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Q96MF0 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Q96MF0 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Q96MF0 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Q96MF0 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Q96MF0 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Q96MF0 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Q96MF0 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Q96MF0 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Q96MF0 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Q96MF0 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Q96MF0 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Q96MF0 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Q96MF0 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Q96MF0 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Q96MF0 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Q96MF0 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Q96MF0 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Q96MF0 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Q96MF0 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Q96MF0 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Q96MF0 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Q96MF0 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Q96MF0 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Q96MF0 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Q96MF0 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Q96MF0 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Q96MF0 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Q96MF0 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Q96MF0 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Q96MF0 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Q96MF0 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Q96MF0 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Q96MF0 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Q96MF0 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Q96MF0 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Q96MF0 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Q96MF0 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Q96MF0 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.1 ms