Protein–RNA interactions for Protein: Q96M20

CNBD2, Cyclic nucleotide-binding domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 576 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNBD2Q96M20 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CNBD2Q96M20 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CNBD2Q96M20 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CNBD2Q96M20 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CNBD2Q96M20 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CNBD2Q96M20 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CNBD2Q96M20 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CNBD2Q96M20 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CNBD2Q96M20 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CNBD2Q96M20 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CNBD2Q96M20 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CNBD2Q96M20 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CNBD2Q96M20 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CNBD2Q96M20 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CNBD2Q96M20 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CNBD2Q96M20 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CNBD2Q96M20 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CNBD2Q96M20 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CNBD2Q96M20 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CNBD2Q96M20 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CNBD2Q96M20 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CNBD2Q96M20 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CNBD2Q96M20 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CNBD2Q96M20 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
CNBD2Q96M20 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CNBD2Q96M20 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CNBD2Q96M20 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CNBD2Q96M20 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
CNBD2Q96M20 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CNBD2Q96M20 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CNBD2Q96M20 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CNBD2Q96M20 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CNBD2Q96M20 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CNBD2Q96M20 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CNBD2Q96M20 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CNBD2Q96M20 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CNBD2Q96M20 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CNBD2Q96M20 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CNBD2Q96M20 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CNBD2Q96M20 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CNBD2Q96M20 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CNBD2Q96M20 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CNBD2Q96M20 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CNBD2Q96M20 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CNBD2Q96M20 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CNBD2Q96M20 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CNBD2Q96M20 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CNBD2Q96M20 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CNBD2Q96M20 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CNBD2Q96M20 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CNBD2Q96M20 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CNBD2Q96M20 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CNBD2Q96M20 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CNBD2Q96M20 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CNBD2Q96M20 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CNBD2Q96M20 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CNBD2Q96M20 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CNBD2Q96M20 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CNBD2Q96M20 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
CNBD2Q96M20 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CNBD2Q96M20 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CNBD2Q96M20 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CNBD2Q96M20 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CNBD2Q96M20 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CNBD2Q96M20 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CNBD2Q96M20 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CNBD2Q96M20 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CNBD2Q96M20 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CNBD2Q96M20 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CNBD2Q96M20 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CNBD2Q96M20 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CNBD2Q96M20 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CNBD2Q96M20 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CNBD2Q96M20 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CNBD2Q96M20 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CNBD2Q96M20 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CNBD2Q96M20 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CNBD2Q96M20 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CNBD2Q96M20 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CNBD2Q96M20 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CNBD2Q96M20 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CNBD2Q96M20 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CNBD2Q96M20 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CNBD2Q96M20 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CNBD2Q96M20 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CNBD2Q96M20 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CNBD2Q96M20 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CNBD2Q96M20 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CNBD2Q96M20 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CNBD2Q96M20 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CNBD2Q96M20 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CNBD2Q96M20 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CNBD2Q96M20 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CNBD2Q96M20 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CNBD2Q96M20 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CNBD2Q96M20 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CNBD2Q96M20 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
CNBD2Q96M20 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CNBD2Q96M20 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CNBD2Q96M20 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms