Protein–RNA interactions for Protein: Q96LZ7

RMDN2, Regulator of microtubule dynamics protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 410 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RMDN2Q96LZ7 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
RMDN2Q96LZ7 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
RMDN2Q96LZ7 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
RMDN2Q96LZ7 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
RMDN2Q96LZ7 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
RMDN2Q96LZ7 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
RMDN2Q96LZ7 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
RMDN2Q96LZ7 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
RMDN2Q96LZ7 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
RMDN2Q96LZ7 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
RMDN2Q96LZ7 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
RMDN2Q96LZ7 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
RMDN2Q96LZ7 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
RMDN2Q96LZ7 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
RMDN2Q96LZ7 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
RMDN2Q96LZ7 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
RMDN2Q96LZ7 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC26.19■■□□□ 1.78
RMDN2Q96LZ7 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
RMDN2Q96LZ7 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
RMDN2Q96LZ7 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
RMDN2Q96LZ7 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
RMDN2Q96LZ7 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
RMDN2Q96LZ7 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
RMDN2Q96LZ7 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
RMDN2Q96LZ7 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
RMDN2Q96LZ7 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
RMDN2Q96LZ7 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
RMDN2Q96LZ7 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
RMDN2Q96LZ7 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
RMDN2Q96LZ7 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
RMDN2Q96LZ7 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
RMDN2Q96LZ7 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
RMDN2Q96LZ7 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
RMDN2Q96LZ7 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
RMDN2Q96LZ7 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
RMDN2Q96LZ7 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
RMDN2Q96LZ7 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
RMDN2Q96LZ7 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
RMDN2Q96LZ7 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
RMDN2Q96LZ7 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
RMDN2Q96LZ7 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
RMDN2Q96LZ7 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
RMDN2Q96LZ7 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
RMDN2Q96LZ7 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
RMDN2Q96LZ7 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
RMDN2Q96LZ7 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
RMDN2Q96LZ7 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
RMDN2Q96LZ7 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
RMDN2Q96LZ7 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
RMDN2Q96LZ7 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
RMDN2Q96LZ7 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
RMDN2Q96LZ7 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
RMDN2Q96LZ7 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
RMDN2Q96LZ7 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
RMDN2Q96LZ7 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
RMDN2Q96LZ7 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
RMDN2Q96LZ7 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
RMDN2Q96LZ7 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
RMDN2Q96LZ7 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
RMDN2Q96LZ7 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
RMDN2Q96LZ7 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
RMDN2Q96LZ7 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
RMDN2Q96LZ7 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
RMDN2Q96LZ7 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
RMDN2Q96LZ7 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
RMDN2Q96LZ7 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
RMDN2Q96LZ7 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
RMDN2Q96LZ7 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
RMDN2Q96LZ7 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
RMDN2Q96LZ7 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
RMDN2Q96LZ7 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
RMDN2Q96LZ7 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
RMDN2Q96LZ7 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
RMDN2Q96LZ7 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
RMDN2Q96LZ7 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
RMDN2Q96LZ7 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
RMDN2Q96LZ7 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
RMDN2Q96LZ7 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
RMDN2Q96LZ7 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC26■■□□□ 1.75
RMDN2Q96LZ7 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
RMDN2Q96LZ7 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
RMDN2Q96LZ7 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
RMDN2Q96LZ7 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
RMDN2Q96LZ7 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
RMDN2Q96LZ7 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
RMDN2Q96LZ7 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
RMDN2Q96LZ7 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
RMDN2Q96LZ7 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
RMDN2Q96LZ7 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC25.99■■□□□ 1.75
RMDN2Q96LZ7 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
RMDN2Q96LZ7 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
RMDN2Q96LZ7 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
RMDN2Q96LZ7 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
RMDN2Q96LZ7 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
RMDN2Q96LZ7 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
RMDN2Q96LZ7 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
RMDN2Q96LZ7 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
RMDN2Q96LZ7 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
RMDN2Q96LZ7 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
RMDN2Q96LZ7 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.7 ms