Protein–RNA interactions for Protein: Q96LW4

PRIMPOL, DNA-directed primase/polymerase protein, humanhuman

Predictions only

Length 560 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRIMPOLQ96LW4 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
PRIMPOLQ96LW4 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
PRIMPOLQ96LW4 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
PRIMPOLQ96LW4 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
PRIMPOLQ96LW4 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
PRIMPOLQ96LW4 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC29.3■■■□□ 2.28
PRIMPOLQ96LW4 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
PRIMPOLQ96LW4 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
PRIMPOLQ96LW4 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
PRIMPOLQ96LW4 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
PRIMPOLQ96LW4 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
PRIMPOLQ96LW4 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
PRIMPOLQ96LW4 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
PRIMPOLQ96LW4 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
PRIMPOLQ96LW4 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
PRIMPOLQ96LW4 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
PRIMPOLQ96LW4 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
PRIMPOLQ96LW4 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
PRIMPOLQ96LW4 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
PRIMPOLQ96LW4 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
PRIMPOLQ96LW4 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
PRIMPOLQ96LW4 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
PRIMPOLQ96LW4 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
PRIMPOLQ96LW4 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
PRIMPOLQ96LW4 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
PRIMPOLQ96LW4 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
PRIMPOLQ96LW4 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
PRIMPOLQ96LW4 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC29.22■■■□□ 2.27
PRIMPOLQ96LW4 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC29.22■■■□□ 2.27
PRIMPOLQ96LW4 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC29.22■■■□□ 2.27
PRIMPOLQ96LW4 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
PRIMPOLQ96LW4 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
PRIMPOLQ96LW4 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
PRIMPOLQ96LW4 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
PRIMPOLQ96LW4 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
PRIMPOLQ96LW4 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
PRIMPOLQ96LW4 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
PRIMPOLQ96LW4 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
PRIMPOLQ96LW4 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
PRIMPOLQ96LW4 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
PRIMPOLQ96LW4 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
PRIMPOLQ96LW4 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
PRIMPOLQ96LW4 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
PRIMPOLQ96LW4 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
PRIMPOLQ96LW4 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
PRIMPOLQ96LW4 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
PRIMPOLQ96LW4 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
PRIMPOLQ96LW4 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
PRIMPOLQ96LW4 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
PRIMPOLQ96LW4 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
PRIMPOLQ96LW4 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
PRIMPOLQ96LW4 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
PRIMPOLQ96LW4 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
PRIMPOLQ96LW4 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
PRIMPOLQ96LW4 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
PRIMPOLQ96LW4 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
PRIMPOLQ96LW4 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
PRIMPOLQ96LW4 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
PRIMPOLQ96LW4 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
PRIMPOLQ96LW4 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
PRIMPOLQ96LW4 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
PRIMPOLQ96LW4 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
PRIMPOLQ96LW4 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
PRIMPOLQ96LW4 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
PRIMPOLQ96LW4 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
PRIMPOLQ96LW4 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC29.14■■■□□ 2.26
PRIMPOLQ96LW4 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
PRIMPOLQ96LW4 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
PRIMPOLQ96LW4 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
PRIMPOLQ96LW4 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC29.12■■■□□ 2.25
PRIMPOLQ96LW4 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
PRIMPOLQ96LW4 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC29.12■■■□□ 2.25
PRIMPOLQ96LW4 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
PRIMPOLQ96LW4 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC29.11■■■□□ 2.25
PRIMPOLQ96LW4 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
PRIMPOLQ96LW4 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
PRIMPOLQ96LW4 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
PRIMPOLQ96LW4 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
PRIMPOLQ96LW4 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
PRIMPOLQ96LW4 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
PRIMPOLQ96LW4 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
PRIMPOLQ96LW4 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
PRIMPOLQ96LW4 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
PRIMPOLQ96LW4 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
PRIMPOLQ96LW4 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
PRIMPOLQ96LW4 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
PRIMPOLQ96LW4 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
PRIMPOLQ96LW4 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
PRIMPOLQ96LW4 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
PRIMPOLQ96LW4 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC29.05■■■□□ 2.24
PRIMPOLQ96LW4 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
PRIMPOLQ96LW4 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
PRIMPOLQ96LW4 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
PRIMPOLQ96LW4 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.02■■■□□ 2.24
PRIMPOLQ96LW4 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
PRIMPOLQ96LW4 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
PRIMPOLQ96LW4 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
PRIMPOLQ96LW4 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
PRIMPOLQ96LW4 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
PRIMPOLQ96LW4 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 1400.6 ms