Protein–RNA interactions for Protein: Q96LT9

RNPC3, RNA-binding protein 40, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNPC3Q96LT9 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
RNPC3Q96LT9 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
RNPC3Q96LT9 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC29.14■■■□□ 2.26
RNPC3Q96LT9 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
RNPC3Q96LT9 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
RNPC3Q96LT9 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
RNPC3Q96LT9 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
RNPC3Q96LT9 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
RNPC3Q96LT9 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
RNPC3Q96LT9 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
RNPC3Q96LT9 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
RNPC3Q96LT9 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
RNPC3Q96LT9 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
RNPC3Q96LT9 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
RNPC3Q96LT9 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
RNPC3Q96LT9 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
RNPC3Q96LT9 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
RNPC3Q96LT9 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
RNPC3Q96LT9 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
RNPC3Q96LT9 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
RNPC3Q96LT9 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
RNPC3Q96LT9 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
RNPC3Q96LT9 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
RNPC3Q96LT9 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
RNPC3Q96LT9 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
RNPC3Q96LT9 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
RNPC3Q96LT9 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
RNPC3Q96LT9 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC29.02■■■□□ 2.24
RNPC3Q96LT9 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
RNPC3Q96LT9 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
RNPC3Q96LT9 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.24
RNPC3Q96LT9 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
RNPC3Q96LT9 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
RNPC3Q96LT9 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.01■■■□□ 2.23
RNPC3Q96LT9 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC29.01■■■□□ 2.23
RNPC3Q96LT9 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
RNPC3Q96LT9 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
RNPC3Q96LT9 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
RNPC3Q96LT9 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
RNPC3Q96LT9 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
RNPC3Q96LT9 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
RNPC3Q96LT9 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
RNPC3Q96LT9 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC28.96■■■□□ 2.23
RNPC3Q96LT9 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC28.96■■■□□ 2.23
RNPC3Q96LT9 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
RNPC3Q96LT9 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
RNPC3Q96LT9 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.23
RNPC3Q96LT9 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC28.95■■■□□ 2.23
RNPC3Q96LT9 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
RNPC3Q96LT9 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
RNPC3Q96LT9 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.93■■■□□ 2.22
RNPC3Q96LT9 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
RNPC3Q96LT9 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC28.93■■■□□ 2.22
RNPC3Q96LT9 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
RNPC3Q96LT9 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
RNPC3Q96LT9 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
RNPC3Q96LT9 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
RNPC3Q96LT9 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
RNPC3Q96LT9 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
RNPC3Q96LT9 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
RNPC3Q96LT9 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
RNPC3Q96LT9 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
RNPC3Q96LT9 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
RNPC3Q96LT9 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
RNPC3Q96LT9 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.21
RNPC3Q96LT9 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
RNPC3Q96LT9 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
RNPC3Q96LT9 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
RNPC3Q96LT9 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
RNPC3Q96LT9 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
RNPC3Q96LT9 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
RNPC3Q96LT9 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
RNPC3Q96LT9 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
RNPC3Q96LT9 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
RNPC3Q96LT9 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
RNPC3Q96LT9 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
RNPC3Q96LT9 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
RNPC3Q96LT9 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC28.85■■■□□ 2.21
RNPC3Q96LT9 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
RNPC3Q96LT9 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
RNPC3Q96LT9 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
RNPC3Q96LT9 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
RNPC3Q96LT9 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
RNPC3Q96LT9 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
RNPC3Q96LT9 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
RNPC3Q96LT9 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
RNPC3Q96LT9 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
RNPC3Q96LT9 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
RNPC3Q96LT9 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC28.81■■■□□ 2.2
RNPC3Q96LT9 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
RNPC3Q96LT9 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
RNPC3Q96LT9 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
RNPC3Q96LT9 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
RNPC3Q96LT9 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
RNPC3Q96LT9 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
RNPC3Q96LT9 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
RNPC3Q96LT9 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
RNPC3Q96LT9 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
RNPC3Q96LT9 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
RNPC3Q96LT9 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 110.1 ms