Protein–RNA interactions for Protein: Q96L46

CAPNS2, Calpain small subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS2Q96L46 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
CAPNS2Q96L46 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC31.01■■■□□ 2.55
CAPNS2Q96L46 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC31■■■□□ 2.55
CAPNS2Q96L46 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC30.99■■■□□ 2.55
CAPNS2Q96L46 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
CAPNS2Q96L46 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
CAPNS2Q96L46 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
CAPNS2Q96L46 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC30.98■■■□□ 2.55
CAPNS2Q96L46 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC30.98■■■□□ 2.55
CAPNS2Q96L46 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC30.97■■■□□ 2.55
CAPNS2Q96L46 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC30.97■■■□□ 2.55
CAPNS2Q96L46 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
CAPNS2Q96L46 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC30.97■■■□□ 2.55
CAPNS2Q96L46 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
CAPNS2Q96L46 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
CAPNS2Q96L46 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC30.94■■■□□ 2.54
CAPNS2Q96L46 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
CAPNS2Q96L46 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC30.92■■■□□ 2.54
CAPNS2Q96L46 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.92■■■□□ 2.54
CAPNS2Q96L46 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC30.91■■■□□ 2.54
CAPNS2Q96L46 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC30.91■■■□□ 2.54
CAPNS2Q96L46 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC30.91■■■□□ 2.54
CAPNS2Q96L46 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC30.91■■■□□ 2.54
CAPNS2Q96L46 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
CAPNS2Q96L46 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC30.9■■■□□ 2.54
CAPNS2Q96L46 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC30.9■■■□□ 2.54
CAPNS2Q96L46 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC30.89■■■□□ 2.54
CAPNS2Q96L46 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC30.88■■■□□ 2.53
CAPNS2Q96L46 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
CAPNS2Q96L46 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
CAPNS2Q96L46 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
CAPNS2Q96L46 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC30.87■■■□□ 2.53
CAPNS2Q96L46 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC30.87■■■□□ 2.53
CAPNS2Q96L46 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.87■■■□□ 2.53
CAPNS2Q96L46 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC30.86■■■□□ 2.53
CAPNS2Q96L46 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC30.86■■■□□ 2.53
CAPNS2Q96L46 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
CAPNS2Q96L46 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC30.84■■■□□ 2.53
CAPNS2Q96L46 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
CAPNS2Q96L46 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
CAPNS2Q96L46 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
CAPNS2Q96L46 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
CAPNS2Q96L46 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC30.82■■■□□ 2.52
CAPNS2Q96L46 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
CAPNS2Q96L46 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
CAPNS2Q96L46 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
CAPNS2Q96L46 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC30.8■■■□□ 2.52
CAPNS2Q96L46 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.79■■■□□ 2.52
CAPNS2Q96L46 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC30.78■■■□□ 2.52
CAPNS2Q96L46 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC30.78■■■□□ 2.52
CAPNS2Q96L46 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
CAPNS2Q96L46 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
CAPNS2Q96L46 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
CAPNS2Q96L46 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC30.75■■■□□ 2.51
CAPNS2Q96L46 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC30.74■■■□□ 2.51
CAPNS2Q96L46 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
CAPNS2Q96L46 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC30.73■■■□□ 2.51
CAPNS2Q96L46 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
CAPNS2Q96L46 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.72■■■□□ 2.51
CAPNS2Q96L46 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.71■■■□□ 2.51
CAPNS2Q96L46 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC30.71■■■□□ 2.51
CAPNS2Q96L46 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
CAPNS2Q96L46 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
CAPNS2Q96L46 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
CAPNS2Q96L46 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
CAPNS2Q96L46 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC30.7■■■□□ 2.51
CAPNS2Q96L46 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC30.7■■■□□ 2.51
CAPNS2Q96L46 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC30.7■■■□□ 2.5
CAPNS2Q96L46 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
CAPNS2Q96L46 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC30.68■■■□□ 2.5
CAPNS2Q96L46 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
CAPNS2Q96L46 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
CAPNS2Q96L46 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
CAPNS2Q96L46 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
CAPNS2Q96L46 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC30.66■■■□□ 2.5
CAPNS2Q96L46 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC30.66■■■□□ 2.5
CAPNS2Q96L46 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC30.66■■■□□ 2.5
CAPNS2Q96L46 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC30.65■■■□□ 2.5
CAPNS2Q96L46 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC30.65■■■□□ 2.5
CAPNS2Q96L46 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC30.64■■■□□ 2.5
CAPNS2Q96L46 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
CAPNS2Q96L46 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC30.64■■■□□ 2.5
CAPNS2Q96L46 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC30.63■■■□□ 2.49
CAPNS2Q96L46 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC30.63■■■□□ 2.49
CAPNS2Q96L46 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
CAPNS2Q96L46 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
CAPNS2Q96L46 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC30.62■■■□□ 2.49
CAPNS2Q96L46 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
CAPNS2Q96L46 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC30.61■■■□□ 2.49
CAPNS2Q96L46 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC30.61■■■□□ 2.49
CAPNS2Q96L46 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
CAPNS2Q96L46 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC30.61■■■□□ 2.49
CAPNS2Q96L46 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
CAPNS2Q96L46 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC30.59■■■□□ 2.49
CAPNS2Q96L46 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
CAPNS2Q96L46 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC30.58■■■□□ 2.49
CAPNS2Q96L46 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
CAPNS2Q96L46 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC30.57■■■□□ 2.48
CAPNS2Q96L46 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC30.57■■■□□ 2.48
CAPNS2Q96L46 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms