Protein–RNA interactions for Protein: Q96KJ9

COX4I2, Cytochrome c oxidase subunit 4 isoform 2, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 171 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COX4I2Q96KJ9 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
COX4I2Q96KJ9 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
COX4I2Q96KJ9 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
COX4I2Q96KJ9 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
COX4I2Q96KJ9 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
COX4I2Q96KJ9 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
COX4I2Q96KJ9 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
COX4I2Q96KJ9 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
COX4I2Q96KJ9 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
COX4I2Q96KJ9 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
COX4I2Q96KJ9 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
COX4I2Q96KJ9 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
COX4I2Q96KJ9 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
COX4I2Q96KJ9 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
COX4I2Q96KJ9 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
COX4I2Q96KJ9 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
COX4I2Q96KJ9 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
COX4I2Q96KJ9 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
COX4I2Q96KJ9 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
COX4I2Q96KJ9 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
COX4I2Q96KJ9 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
COX4I2Q96KJ9 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
COX4I2Q96KJ9 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
COX4I2Q96KJ9 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
COX4I2Q96KJ9 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
COX4I2Q96KJ9 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
COX4I2Q96KJ9 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
COX4I2Q96KJ9 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
COX4I2Q96KJ9 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
COX4I2Q96KJ9 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
COX4I2Q96KJ9 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
COX4I2Q96KJ9 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
COX4I2Q96KJ9 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
COX4I2Q96KJ9 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
COX4I2Q96KJ9 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
COX4I2Q96KJ9 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
COX4I2Q96KJ9 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
COX4I2Q96KJ9 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
COX4I2Q96KJ9 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
COX4I2Q96KJ9 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
COX4I2Q96KJ9 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
COX4I2Q96KJ9 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
COX4I2Q96KJ9 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
COX4I2Q96KJ9 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
COX4I2Q96KJ9 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
COX4I2Q96KJ9 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
COX4I2Q96KJ9 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
COX4I2Q96KJ9 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
COX4I2Q96KJ9 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
COX4I2Q96KJ9 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
COX4I2Q96KJ9 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
COX4I2Q96KJ9 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
COX4I2Q96KJ9 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
COX4I2Q96KJ9 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
COX4I2Q96KJ9 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
COX4I2Q96KJ9 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
COX4I2Q96KJ9 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
COX4I2Q96KJ9 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
COX4I2Q96KJ9 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
COX4I2Q96KJ9 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
COX4I2Q96KJ9 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
COX4I2Q96KJ9 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
COX4I2Q96KJ9 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
COX4I2Q96KJ9 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
COX4I2Q96KJ9 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
COX4I2Q96KJ9 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
COX4I2Q96KJ9 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
COX4I2Q96KJ9 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
COX4I2Q96KJ9 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
COX4I2Q96KJ9 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
COX4I2Q96KJ9 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
COX4I2Q96KJ9 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
COX4I2Q96KJ9 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
COX4I2Q96KJ9 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
COX4I2Q96KJ9 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
COX4I2Q96KJ9 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
COX4I2Q96KJ9 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
COX4I2Q96KJ9 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
COX4I2Q96KJ9 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
COX4I2Q96KJ9 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
COX4I2Q96KJ9 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
COX4I2Q96KJ9 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
COX4I2Q96KJ9 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
COX4I2Q96KJ9 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
COX4I2Q96KJ9 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
COX4I2Q96KJ9 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
COX4I2Q96KJ9 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
COX4I2Q96KJ9 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
COX4I2Q96KJ9 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
COX4I2Q96KJ9 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
COX4I2Q96KJ9 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
COX4I2Q96KJ9 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
COX4I2Q96KJ9 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
COX4I2Q96KJ9 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
COX4I2Q96KJ9 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
COX4I2Q96KJ9 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
COX4I2Q96KJ9 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
COX4I2Q96KJ9 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
COX4I2Q96KJ9 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
COX4I2Q96KJ9 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 129.8 ms