Protein–RNA interactions for Protein: Q96K19

RNF170, E3 ubiquitin-protein ligase RNF170, humanhuman

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF170Q96K19 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RNF170Q96K19 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RNF170Q96K19 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RNF170Q96K19 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RNF170Q96K19 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RNF170Q96K19 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RNF170Q96K19 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RNF170Q96K19 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RNF170Q96K19 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RNF170Q96K19 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RNF170Q96K19 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RNF170Q96K19 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RNF170Q96K19 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
RNF170Q96K19 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RNF170Q96K19 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RNF170Q96K19 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RNF170Q96K19 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RNF170Q96K19 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RNF170Q96K19 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RNF170Q96K19 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RNF170Q96K19 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RNF170Q96K19 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RNF170Q96K19 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RNF170Q96K19 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RNF170Q96K19 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
RNF170Q96K19 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RNF170Q96K19 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RNF170Q96K19 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RNF170Q96K19 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RNF170Q96K19 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RNF170Q96K19 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RNF170Q96K19 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RNF170Q96K19 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RNF170Q96K19 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RNF170Q96K19 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
RNF170Q96K19 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RNF170Q96K19 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RNF170Q96K19 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RNF170Q96K19 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RNF170Q96K19 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RNF170Q96K19 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RNF170Q96K19 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
RNF170Q96K19 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RNF170Q96K19 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RNF170Q96K19 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RNF170Q96K19 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
RNF170Q96K19 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RNF170Q96K19 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RNF170Q96K19 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RNF170Q96K19 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RNF170Q96K19 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RNF170Q96K19 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RNF170Q96K19 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RNF170Q96K19 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RNF170Q96K19 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RNF170Q96K19 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RNF170Q96K19 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RNF170Q96K19 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RNF170Q96K19 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RNF170Q96K19 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
RNF170Q96K19 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RNF170Q96K19 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RNF170Q96K19 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RNF170Q96K19 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RNF170Q96K19 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RNF170Q96K19 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RNF170Q96K19 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RNF170Q96K19 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RNF170Q96K19 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RNF170Q96K19 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RNF170Q96K19 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RNF170Q96K19 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RNF170Q96K19 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RNF170Q96K19 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RNF170Q96K19 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RNF170Q96K19 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RNF170Q96K19 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RNF170Q96K19 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RNF170Q96K19 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RNF170Q96K19 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RNF170Q96K19 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RNF170Q96K19 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RNF170Q96K19 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RNF170Q96K19 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RNF170Q96K19 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RNF170Q96K19 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RNF170Q96K19 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RNF170Q96K19 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RNF170Q96K19 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RNF170Q96K19 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
RNF170Q96K19 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
RNF170Q96K19 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
RNF170Q96K19 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RNF170Q96K19 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RNF170Q96K19 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RNF170Q96K19 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RNF170Q96K19 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RNF170Q96K19 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RNF170Q96K19 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RNF170Q96K19 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.3 ms