Protein–RNA interactions for Protein: Q96JS3

PGBD1, PiggyBac transposable element-derived protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 809 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGBD1Q96JS3 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
PGBD1Q96JS3 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
PGBD1Q96JS3 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
PGBD1Q96JS3 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
PGBD1Q96JS3 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
PGBD1Q96JS3 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
PGBD1Q96JS3 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.21■■■□□ 2.43
PGBD1Q96JS3 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.2■■■□□ 2.43
PGBD1Q96JS3 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.2■■■□□ 2.43
PGBD1Q96JS3 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC30.2■■■□□ 2.43
PGBD1Q96JS3 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
PGBD1Q96JS3 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC30.19■■■□□ 2.42
PGBD1Q96JS3 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC30.18■■■□□ 2.42
PGBD1Q96JS3 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC30.18■■■□□ 2.42
PGBD1Q96JS3 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
PGBD1Q96JS3 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
PGBD1Q96JS3 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC30.17■■■□□ 2.42
PGBD1Q96JS3 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
PGBD1Q96JS3 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
PGBD1Q96JS3 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
PGBD1Q96JS3 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC30.15■■■□□ 2.42
PGBD1Q96JS3 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
PGBD1Q96JS3 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
PGBD1Q96JS3 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC30.14■■■□□ 2.42
PGBD1Q96JS3 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
PGBD1Q96JS3 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
PGBD1Q96JS3 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
PGBD1Q96JS3 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
PGBD1Q96JS3 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
PGBD1Q96JS3 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
PGBD1Q96JS3 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC30.11■■■□□ 2.41
PGBD1Q96JS3 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
PGBD1Q96JS3 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
PGBD1Q96JS3 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
PGBD1Q96JS3 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
PGBD1Q96JS3 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
PGBD1Q96JS3 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
PGBD1Q96JS3 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
PGBD1Q96JS3 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
PGBD1Q96JS3 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
PGBD1Q96JS3 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
PGBD1Q96JS3 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC30.09■■■□□ 2.41
PGBD1Q96JS3 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
PGBD1Q96JS3 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
PGBD1Q96JS3 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC30.07■■■□□ 2.4
PGBD1Q96JS3 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
PGBD1Q96JS3 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
PGBD1Q96JS3 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
PGBD1Q96JS3 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
PGBD1Q96JS3 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
PGBD1Q96JS3 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
PGBD1Q96JS3 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
PGBD1Q96JS3 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
PGBD1Q96JS3 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
PGBD1Q96JS3 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
PGBD1Q96JS3 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
PGBD1Q96JS3 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
PGBD1Q96JS3 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
PGBD1Q96JS3 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.39
PGBD1Q96JS3 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.39
PGBD1Q96JS3 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.01■■■□□ 2.39
PGBD1Q96JS3 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.39
PGBD1Q96JS3 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC30.01■■■□□ 2.39
PGBD1Q96JS3 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.39
PGBD1Q96JS3 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
PGBD1Q96JS3 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
PGBD1Q96JS3 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
PGBD1Q96JS3 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
PGBD1Q96JS3 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
PGBD1Q96JS3 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
PGBD1Q96JS3 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
PGBD1Q96JS3 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
PGBD1Q96JS3 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC29.98■■■□□ 2.39
PGBD1Q96JS3 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
PGBD1Q96JS3 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
PGBD1Q96JS3 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
PGBD1Q96JS3 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
PGBD1Q96JS3 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
PGBD1Q96JS3 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
PGBD1Q96JS3 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.39
PGBD1Q96JS3 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC29.95■■■□□ 2.39
PGBD1Q96JS3 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
PGBD1Q96JS3 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC29.94■■■□□ 2.38
PGBD1Q96JS3 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
PGBD1Q96JS3 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
PGBD1Q96JS3 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
PGBD1Q96JS3 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
PGBD1Q96JS3 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC29.93■■■□□ 2.38
PGBD1Q96JS3 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC29.93■■■□□ 2.38
PGBD1Q96JS3 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
PGBD1Q96JS3 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC29.92■■■□□ 2.38
PGBD1Q96JS3 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
PGBD1Q96JS3 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC29.91■■■□□ 2.38
PGBD1Q96JS3 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
PGBD1Q96JS3 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC29.9■■■□□ 2.38
PGBD1Q96JS3 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
PGBD1Q96JS3 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC29.9■■■□□ 2.38
PGBD1Q96JS3 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
PGBD1Q96JS3 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
PGBD1Q96JS3 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms