Protein–RNA interactions for Protein: Q96JM3

CHAMP1, Chromosome alignment-maintaining phosphoprotein 1, humanhuman

Predictions only

Length 812 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAMP1Q96JM3 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
CHAMP1Q96JM3 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
CHAMP1Q96JM3 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
CHAMP1Q96JM3 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
CHAMP1Q96JM3 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
CHAMP1Q96JM3 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
CHAMP1Q96JM3 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
CHAMP1Q96JM3 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
CHAMP1Q96JM3 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
CHAMP1Q96JM3 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
CHAMP1Q96JM3 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
CHAMP1Q96JM3 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
CHAMP1Q96JM3 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.04■■■□□ 2.4
CHAMP1Q96JM3 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
CHAMP1Q96JM3 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
CHAMP1Q96JM3 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
CHAMP1Q96JM3 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
CHAMP1Q96JM3 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC30.01■■■□□ 2.39
CHAMP1Q96JM3 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.39
CHAMP1Q96JM3 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
CHAMP1Q96JM3 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
CHAMP1Q96JM3 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
CHAMP1Q96JM3 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
CHAMP1Q96JM3 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
CHAMP1Q96JM3 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
CHAMP1Q96JM3 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
CHAMP1Q96JM3 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
CHAMP1Q96JM3 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
CHAMP1Q96JM3 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
CHAMP1Q96JM3 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
CHAMP1Q96JM3 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC29.98■■■□□ 2.39
CHAMP1Q96JM3 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC29.98■■■□□ 2.39
CHAMP1Q96JM3 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
CHAMP1Q96JM3 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
CHAMP1Q96JM3 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
CHAMP1Q96JM3 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
CHAMP1Q96JM3 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC29.96■■■□□ 2.39
CHAMP1Q96JM3 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
CHAMP1Q96JM3 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC29.96■■■□□ 2.39
CHAMP1Q96JM3 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
CHAMP1Q96JM3 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
CHAMP1Q96JM3 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
CHAMP1Q96JM3 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
CHAMP1Q96JM3 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
CHAMP1Q96JM3 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
CHAMP1Q96JM3 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
CHAMP1Q96JM3 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
CHAMP1Q96JM3 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC29.93■■■□□ 2.38
CHAMP1Q96JM3 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
CHAMP1Q96JM3 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
CHAMP1Q96JM3 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
CHAMP1Q96JM3 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
CHAMP1Q96JM3 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
CHAMP1Q96JM3 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
CHAMP1Q96JM3 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
CHAMP1Q96JM3 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
CHAMP1Q96JM3 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
CHAMP1Q96JM3 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
CHAMP1Q96JM3 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
CHAMP1Q96JM3 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC29.9■■■□□ 2.38
CHAMP1Q96JM3 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC29.9■■■□□ 2.38
CHAMP1Q96JM3 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
CHAMP1Q96JM3 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
CHAMP1Q96JM3 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.37
CHAMP1Q96JM3 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.37
CHAMP1Q96JM3 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC29.88■■■□□ 2.37
CHAMP1Q96JM3 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
CHAMP1Q96JM3 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
CHAMP1Q96JM3 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
CHAMP1Q96JM3 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
CHAMP1Q96JM3 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC29.88■■■□□ 2.37
CHAMP1Q96JM3 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
CHAMP1Q96JM3 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
CHAMP1Q96JM3 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
CHAMP1Q96JM3 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC29.87■■■□□ 2.37
CHAMP1Q96JM3 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
CHAMP1Q96JM3 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
CHAMP1Q96JM3 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
CHAMP1Q96JM3 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC29.85■■■□□ 2.37
CHAMP1Q96JM3 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.85■■■□□ 2.37
CHAMP1Q96JM3 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
CHAMP1Q96JM3 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
CHAMP1Q96JM3 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
CHAMP1Q96JM3 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
CHAMP1Q96JM3 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.37
CHAMP1Q96JM3 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
CHAMP1Q96JM3 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
CHAMP1Q96JM3 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
CHAMP1Q96JM3 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
CHAMP1Q96JM3 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
CHAMP1Q96JM3 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
CHAMP1Q96JM3 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
CHAMP1Q96JM3 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
CHAMP1Q96JM3 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC29.81■■■□□ 2.36
CHAMP1Q96JM3 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
CHAMP1Q96JM3 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
CHAMP1Q96JM3 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC29.8■■■□□ 2.36
CHAMP1Q96JM3 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
CHAMP1Q96JM3 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
CHAMP1Q96JM3 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC29.78■■■□□ 2.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 105 ms