Protein–RNA interactions for Protein: Q96JC9

EAF1, ELL-associated factor 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EAF1Q96JC9 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
EAF1Q96JC9 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
EAF1Q96JC9 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
EAF1Q96JC9 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
EAF1Q96JC9 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
EAF1Q96JC9 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
EAF1Q96JC9 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
EAF1Q96JC9 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
EAF1Q96JC9 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
EAF1Q96JC9 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
EAF1Q96JC9 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
EAF1Q96JC9 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
EAF1Q96JC9 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
EAF1Q96JC9 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
EAF1Q96JC9 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
EAF1Q96JC9 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
EAF1Q96JC9 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
EAF1Q96JC9 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
EAF1Q96JC9 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
EAF1Q96JC9 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
EAF1Q96JC9 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
EAF1Q96JC9 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
EAF1Q96JC9 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
EAF1Q96JC9 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
EAF1Q96JC9 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
EAF1Q96JC9 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
EAF1Q96JC9 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
EAF1Q96JC9 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
EAF1Q96JC9 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
EAF1Q96JC9 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
EAF1Q96JC9 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
EAF1Q96JC9 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
EAF1Q96JC9 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
EAF1Q96JC9 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
EAF1Q96JC9 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
EAF1Q96JC9 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
EAF1Q96JC9 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
EAF1Q96JC9 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
EAF1Q96JC9 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
EAF1Q96JC9 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
EAF1Q96JC9 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
EAF1Q96JC9 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
EAF1Q96JC9 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
EAF1Q96JC9 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
EAF1Q96JC9 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
EAF1Q96JC9 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
EAF1Q96JC9 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
EAF1Q96JC9 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
EAF1Q96JC9 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
EAF1Q96JC9 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC20.87■□□□□ 0.93
EAF1Q96JC9 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
EAF1Q96JC9 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
EAF1Q96JC9 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
EAF1Q96JC9 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
EAF1Q96JC9 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
EAF1Q96JC9 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
EAF1Q96JC9 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
EAF1Q96JC9 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
EAF1Q96JC9 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
EAF1Q96JC9 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
EAF1Q96JC9 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
EAF1Q96JC9 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
EAF1Q96JC9 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
EAF1Q96JC9 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
EAF1Q96JC9 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.93
EAF1Q96JC9 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
EAF1Q96JC9 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
EAF1Q96JC9 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
EAF1Q96JC9 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
EAF1Q96JC9 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
EAF1Q96JC9 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
EAF1Q96JC9 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
EAF1Q96JC9 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
EAF1Q96JC9 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
EAF1Q96JC9 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
EAF1Q96JC9 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
EAF1Q96JC9 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
EAF1Q96JC9 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
EAF1Q96JC9 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
EAF1Q96JC9 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
EAF1Q96JC9 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
EAF1Q96JC9 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
EAF1Q96JC9 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
EAF1Q96JC9 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
EAF1Q96JC9 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
EAF1Q96JC9 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
EAF1Q96JC9 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
EAF1Q96JC9 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
EAF1Q96JC9 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
EAF1Q96JC9 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
EAF1Q96JC9 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
EAF1Q96JC9 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
EAF1Q96JC9 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
EAF1Q96JC9 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
EAF1Q96JC9 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
EAF1Q96JC9 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC20.73■□□□□ 0.91
EAF1Q96JC9 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
EAF1Q96JC9 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
EAF1Q96JC9 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
EAF1Q96JC9 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms