Protein–RNA interactions for Protein: Q96JC4

ZNF479, Zinc finger protein 479, humanhuman

Predictions only

Length 524 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF479Q96JC4 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ZNF479Q96JC4 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ZNF479Q96JC4 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ZNF479Q96JC4 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ZNF479Q96JC4 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ZNF479Q96JC4 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ZNF479Q96JC4 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ZNF479Q96JC4 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ZNF479Q96JC4 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ZNF479Q96JC4 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ZNF479Q96JC4 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ZNF479Q96JC4 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ZNF479Q96JC4 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ZNF479Q96JC4 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ZNF479Q96JC4 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ZNF479Q96JC4 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ZNF479Q96JC4 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ZNF479Q96JC4 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ZNF479Q96JC4 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ZNF479Q96JC4 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ZNF479Q96JC4 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
ZNF479Q96JC4 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ZNF479Q96JC4 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ZNF479Q96JC4 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ZNF479Q96JC4 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ZNF479Q96JC4 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ZNF479Q96JC4 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ZNF479Q96JC4 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ZNF479Q96JC4 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ZNF479Q96JC4 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ZNF479Q96JC4 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ZNF479Q96JC4 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ZNF479Q96JC4 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ZNF479Q96JC4 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ZNF479Q96JC4 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ZNF479Q96JC4 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ZNF479Q96JC4 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ZNF479Q96JC4 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ZNF479Q96JC4 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ZNF479Q96JC4 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ZNF479Q96JC4 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ZNF479Q96JC4 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ZNF479Q96JC4 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ZNF479Q96JC4 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ZNF479Q96JC4 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ZNF479Q96JC4 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ZNF479Q96JC4 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ZNF479Q96JC4 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ZNF479Q96JC4 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ZNF479Q96JC4 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC18.66■□□□□ 0.58
ZNF479Q96JC4 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
ZNF479Q96JC4 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
ZNF479Q96JC4 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
ZNF479Q96JC4 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
ZNF479Q96JC4 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
ZNF479Q96JC4 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
ZNF479Q96JC4 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
ZNF479Q96JC4 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
ZNF479Q96JC4 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
ZNF479Q96JC4 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
ZNF479Q96JC4 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ZNF479Q96JC4 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ZNF479Q96JC4 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
ZNF479Q96JC4 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ZNF479Q96JC4 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ZNF479Q96JC4 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ZNF479Q96JC4 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ZNF479Q96JC4 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ZNF479Q96JC4 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ZNF479Q96JC4 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ZNF479Q96JC4 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ZNF479Q96JC4 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ZNF479Q96JC4 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ZNF479Q96JC4 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ZNF479Q96JC4 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ZNF479Q96JC4 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ZNF479Q96JC4 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ZNF479Q96JC4 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ZNF479Q96JC4 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ZNF479Q96JC4 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ZNF479Q96JC4 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ZNF479Q96JC4 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ZNF479Q96JC4 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ZNF479Q96JC4 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
ZNF479Q96JC4 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ZNF479Q96JC4 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ZNF479Q96JC4 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ZNF479Q96JC4 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ZNF479Q96JC4 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ZNF479Q96JC4 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ZNF479Q96JC4 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ZNF479Q96JC4 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ZNF479Q96JC4 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ZNF479Q96JC4 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ZNF479Q96JC4 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
ZNF479Q96JC4 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ZNF479Q96JC4 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ZNF479Q96JC4 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ZNF479Q96JC4 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ZNF479Q96JC4 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.3 ms