Protein–RNA interactions for Protein: Q96J66

ABCC11, ATP-binding cassette sub-family C member 11, humanhuman

Predictions only

Length 1,382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCC11Q96J66 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37■■■■□ 3.51
ABCC11Q96J66 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37■■■■□ 3.51
ABCC11Q96J66 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC37■■■■□ 3.51
ABCC11Q96J66 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.99■■■■□ 3.51
ABCC11Q96J66 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.98■■■■□ 3.51
ABCC11Q96J66 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC36.98■■■■□ 3.51
ABCC11Q96J66 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC36.98■■■■□ 3.51
ABCC11Q96J66 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC36.98■■■■□ 3.51
ABCC11Q96J66 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC36.98■■■■□ 3.51
ABCC11Q96J66 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC36.97■■■■□ 3.51
ABCC11Q96J66 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC36.96■■■■□ 3.51
ABCC11Q96J66 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC36.95■■■■□ 3.51
ABCC11Q96J66 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC36.95■■■■□ 3.51
ABCC11Q96J66 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.95■■■■□ 3.51
ABCC11Q96J66 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC36.94■■■■□ 3.5
ABCC11Q96J66 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.93■■■■□ 3.5
ABCC11Q96J66 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.93■■■■□ 3.5
ABCC11Q96J66 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC36.92■■■■□ 3.5
ABCC11Q96J66 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC36.92■■■■□ 3.5
ABCC11Q96J66 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC36.91■■■■□ 3.5
ABCC11Q96J66 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.91■■■■□ 3.5
ABCC11Q96J66 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC36.9■■■■□ 3.5
ABCC11Q96J66 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.89■■■■□ 3.5
ABCC11Q96J66 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC36.89■■■■□ 3.5
ABCC11Q96J66 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC36.89■■■■□ 3.5
ABCC11Q96J66 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC36.88■■■■□ 3.49
ABCC11Q96J66 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC36.88■■■■□ 3.49
ABCC11Q96J66 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC36.87■■■■□ 3.49
ABCC11Q96J66 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC36.87■■■■□ 3.49
ABCC11Q96J66 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC36.87■■■■□ 3.49
ABCC11Q96J66 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC36.86■■■■□ 3.49
ABCC11Q96J66 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.86■■■■□ 3.49
ABCC11Q96J66 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC36.85■■■■□ 3.49
ABCC11Q96J66 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.84■■■■□ 3.49
ABCC11Q96J66 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.82■■■■□ 3.49
ABCC11Q96J66 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.82■■■■□ 3.49
ABCC11Q96J66 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.82■■■■□ 3.48
ABCC11Q96J66 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
ABCC11Q96J66 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
ABCC11Q96J66 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
ABCC11Q96J66 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC36.8■■■■□ 3.48
ABCC11Q96J66 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.8■■■■□ 3.48
ABCC11Q96J66 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.8■■■■□ 3.48
ABCC11Q96J66 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC36.79■■■■□ 3.48
ABCC11Q96J66 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC36.78■■■■□ 3.48
ABCC11Q96J66 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC36.76■■■■□ 3.47
ABCC11Q96J66 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.76■■■■□ 3.47
ABCC11Q96J66 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
ABCC11Q96J66 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
ABCC11Q96J66 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC36.74■■■■□ 3.47
ABCC11Q96J66 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.73■■■■□ 3.47
ABCC11Q96J66 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC36.72■■■■□ 3.47
ABCC11Q96J66 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC36.71■■■■□ 3.47
ABCC11Q96J66 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
ABCC11Q96J66 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.47
ABCC11Q96J66 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.47
ABCC11Q96J66 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC36.7■■■■□ 3.47
ABCC11Q96J66 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.47
ABCC11Q96J66 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC36.69■■■■□ 3.46
ABCC11Q96J66 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC36.68■■■■□ 3.46
ABCC11Q96J66 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.66■■■■□ 3.46
ABCC11Q96J66 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC36.66■■■■□ 3.46
ABCC11Q96J66 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
ABCC11Q96J66 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
ABCC11Q96J66 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC36.66■■■■□ 3.46
ABCC11Q96J66 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.65■■■■□ 3.46
ABCC11Q96J66 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC36.65■■■■□ 3.46
ABCC11Q96J66 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.45
ABCC11Q96J66 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
ABCC11Q96J66 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
ABCC11Q96J66 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC36.62■■■■□ 3.45
ABCC11Q96J66 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
ABCC11Q96J66 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC36.61■■■■□ 3.45
ABCC11Q96J66 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
ABCC11Q96J66 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
ABCC11Q96J66 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC36.61■■■■□ 3.45
ABCC11Q96J66 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
ABCC11Q96J66 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
ABCC11Q96J66 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC36.6■■■■□ 3.45
ABCC11Q96J66 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
ABCC11Q96J66 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC36.6■■■■□ 3.45
ABCC11Q96J66 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
ABCC11Q96J66 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.59■■■■□ 3.45
ABCC11Q96J66 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.45
ABCC11Q96J66 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.45
ABCC11Q96J66 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC36.57■■■■□ 3.44
ABCC11Q96J66 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC36.56■■■■□ 3.44
ABCC11Q96J66 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC36.56■■■■□ 3.44
ABCC11Q96J66 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC36.55■■■■□ 3.44
ABCC11Q96J66 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC36.55■■■■□ 3.44
ABCC11Q96J66 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
ABCC11Q96J66 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
ABCC11Q96J66 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC36.53■■■■□ 3.44
ABCC11Q96J66 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
ABCC11Q96J66 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
ABCC11Q96J66 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC36.51■■■■□ 3.43
ABCC11Q96J66 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.43
ABCC11Q96J66 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
ABCC11Q96J66 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
ABCC11Q96J66 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.49■■■■□ 3.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms