Protein–RNA interactions for Protein: Q96J65

ABCC12, Multidrug resistance-associated protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCC12Q96J65 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
ABCC12Q96J65 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
ABCC12Q96J65 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
ABCC12Q96J65 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.83■■■□□ 2.85
ABCC12Q96J65 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC32.83■■■□□ 2.85
ABCC12Q96J65 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.85
ABCC12Q96J65 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
ABCC12Q96J65 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC32.82■■■□□ 2.84
ABCC12Q96J65 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC32.82■■■□□ 2.84
ABCC12Q96J65 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.82■■■□□ 2.84
ABCC12Q96J65 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
ABCC12Q96J65 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC32.81■■■□□ 2.84
ABCC12Q96J65 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC32.81■■■□□ 2.84
ABCC12Q96J65 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
ABCC12Q96J65 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC32.81■■■□□ 2.84
ABCC12Q96J65 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC32.8■■■□□ 2.84
ABCC12Q96J65 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
ABCC12Q96J65 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
ABCC12Q96J65 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
ABCC12Q96J65 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
ABCC12Q96J65 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
ABCC12Q96J65 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
ABCC12Q96J65 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
ABCC12Q96J65 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
ABCC12Q96J65 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
ABCC12Q96J65 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
ABCC12Q96J65 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.78■■■□□ 2.84
ABCC12Q96J65 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
ABCC12Q96J65 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC32.77■■■□□ 2.84
ABCC12Q96J65 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC32.77■■■□□ 2.84
ABCC12Q96J65 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.84
ABCC12Q96J65 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.84
ABCC12Q96J65 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
ABCC12Q96J65 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
ABCC12Q96J65 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
ABCC12Q96J65 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
ABCC12Q96J65 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC32.73■■■□□ 2.83
ABCC12Q96J65 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
ABCC12Q96J65 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
ABCC12Q96J65 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC32.72■■■□□ 2.83
ABCC12Q96J65 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
ABCC12Q96J65 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
ABCC12Q96J65 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC32.71■■■□□ 2.83
ABCC12Q96J65 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC32.71■■■□□ 2.83
ABCC12Q96J65 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
ABCC12Q96J65 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
ABCC12Q96J65 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC32.7■■■□□ 2.82
ABCC12Q96J65 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC32.69■■■□□ 2.82
ABCC12Q96J65 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC32.69■■■□□ 2.82
ABCC12Q96J65 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
ABCC12Q96J65 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
ABCC12Q96J65 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC32.67■■■□□ 2.82
ABCC12Q96J65 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC32.66■■■□□ 2.82
ABCC12Q96J65 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
ABCC12Q96J65 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC32.65■■■□□ 2.82
ABCC12Q96J65 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
ABCC12Q96J65 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
ABCC12Q96J65 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
ABCC12Q96J65 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.63■■■□□ 2.81
ABCC12Q96J65 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.62■■■□□ 2.81
ABCC12Q96J65 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC32.62■■■□□ 2.81
ABCC12Q96J65 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
ABCC12Q96J65 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
ABCC12Q96J65 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
ABCC12Q96J65 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
ABCC12Q96J65 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
ABCC12Q96J65 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
ABCC12Q96J65 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
ABCC12Q96J65 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC32.6■■■□□ 2.81
ABCC12Q96J65 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
ABCC12Q96J65 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC32.59■■■□□ 2.81
ABCC12Q96J65 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.59■■■□□ 2.81
ABCC12Q96J65 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
ABCC12Q96J65 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.59■■■□□ 2.81
ABCC12Q96J65 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC32.58■■■□□ 2.81
ABCC12Q96J65 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC32.58■■■□□ 2.81
ABCC12Q96J65 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC32.58■■■□□ 2.81
ABCC12Q96J65 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC32.57■■■□□ 2.8
ABCC12Q96J65 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
ABCC12Q96J65 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC32.55■■■□□ 2.8
ABCC12Q96J65 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.55■■■□□ 2.8
ABCC12Q96J65 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC32.54■■■□□ 2.8
ABCC12Q96J65 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC32.54■■■□□ 2.8
ABCC12Q96J65 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
ABCC12Q96J65 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
ABCC12Q96J65 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.8
ABCC12Q96J65 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
ABCC12Q96J65 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC32.5■■■□□ 2.79
ABCC12Q96J65 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
ABCC12Q96J65 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
ABCC12Q96J65 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
ABCC12Q96J65 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC32.5■■■□□ 2.79
ABCC12Q96J65 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
ABCC12Q96J65 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
ABCC12Q96J65 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC32.49■■■□□ 2.79
ABCC12Q96J65 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC32.47■■■□□ 2.79
ABCC12Q96J65 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC32.47■■■□□ 2.79
ABCC12Q96J65 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
ABCC12Q96J65 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC32.46■■■□□ 2.79
ABCC12Q96J65 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC32.46■■■□□ 2.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 1266.3 ms