Protein–RNA interactions for Protein: Q96HL8

SH3YL1, SH3 domain-containing YSC84-like protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3YL1Q96HL8 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SH3YL1Q96HL8 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SH3YL1Q96HL8 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SH3YL1Q96HL8 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
SH3YL1Q96HL8 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SH3YL1Q96HL8 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SH3YL1Q96HL8 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SH3YL1Q96HL8 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SH3YL1Q96HL8 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SH3YL1Q96HL8 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SH3YL1Q96HL8 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SH3YL1Q96HL8 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SH3YL1Q96HL8 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SH3YL1Q96HL8 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SH3YL1Q96HL8 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SH3YL1Q96HL8 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SH3YL1Q96HL8 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SH3YL1Q96HL8 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SH3YL1Q96HL8 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SH3YL1Q96HL8 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SH3YL1Q96HL8 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SH3YL1Q96HL8 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SH3YL1Q96HL8 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SH3YL1Q96HL8 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SH3YL1Q96HL8 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SH3YL1Q96HL8 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
SH3YL1Q96HL8 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SH3YL1Q96HL8 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
SH3YL1Q96HL8 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SH3YL1Q96HL8 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SH3YL1Q96HL8 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SH3YL1Q96HL8 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SH3YL1Q96HL8 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SH3YL1Q96HL8 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
SH3YL1Q96HL8 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SH3YL1Q96HL8 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SH3YL1Q96HL8 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SH3YL1Q96HL8 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
SH3YL1Q96HL8 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
SH3YL1Q96HL8 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SH3YL1Q96HL8 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SH3YL1Q96HL8 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SH3YL1Q96HL8 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SH3YL1Q96HL8 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
SH3YL1Q96HL8 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SH3YL1Q96HL8 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SH3YL1Q96HL8 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SH3YL1Q96HL8 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SH3YL1Q96HL8 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SH3YL1Q96HL8 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SH3YL1Q96HL8 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SH3YL1Q96HL8 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SH3YL1Q96HL8 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SH3YL1Q96HL8 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SH3YL1Q96HL8 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SH3YL1Q96HL8 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SH3YL1Q96HL8 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SH3YL1Q96HL8 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SH3YL1Q96HL8 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SH3YL1Q96HL8 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SH3YL1Q96HL8 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SH3YL1Q96HL8 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SH3YL1Q96HL8 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SH3YL1Q96HL8 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SH3YL1Q96HL8 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SH3YL1Q96HL8 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SH3YL1Q96HL8 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SH3YL1Q96HL8 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SH3YL1Q96HL8 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SH3YL1Q96HL8 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SH3YL1Q96HL8 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SH3YL1Q96HL8 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SH3YL1Q96HL8 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SH3YL1Q96HL8 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SH3YL1Q96HL8 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
SH3YL1Q96HL8 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SH3YL1Q96HL8 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SH3YL1Q96HL8 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SH3YL1Q96HL8 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SH3YL1Q96HL8 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SH3YL1Q96HL8 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SH3YL1Q96HL8 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SH3YL1Q96HL8 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SH3YL1Q96HL8 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SH3YL1Q96HL8 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SH3YL1Q96HL8 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SH3YL1Q96HL8 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SH3YL1Q96HL8 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
SH3YL1Q96HL8 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
SH3YL1Q96HL8 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SH3YL1Q96HL8 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
SH3YL1Q96HL8 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SH3YL1Q96HL8 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SH3YL1Q96HL8 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SH3YL1Q96HL8 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
SH3YL1Q96HL8 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SH3YL1Q96HL8 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SH3YL1Q96HL8 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SH3YL1Q96HL8 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SH3YL1Q96HL8 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms