Protein–RNA interactions for Protein: Q96GS4

BORCS6, BLOC-1-related complex subunit 6, humanhuman

Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BORCS6Q96GS4 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
BORCS6Q96GS4 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
BORCS6Q96GS4 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
BORCS6Q96GS4 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
BORCS6Q96GS4 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
BORCS6Q96GS4 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
BORCS6Q96GS4 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
BORCS6Q96GS4 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
BORCS6Q96GS4 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
BORCS6Q96GS4 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
BORCS6Q96GS4 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
BORCS6Q96GS4 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
BORCS6Q96GS4 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
BORCS6Q96GS4 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
BORCS6Q96GS4 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
BORCS6Q96GS4 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
BORCS6Q96GS4 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
BORCS6Q96GS4 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
BORCS6Q96GS4 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
BORCS6Q96GS4 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
BORCS6Q96GS4 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
BORCS6Q96GS4 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
BORCS6Q96GS4 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
BORCS6Q96GS4 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
BORCS6Q96GS4 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
BORCS6Q96GS4 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
BORCS6Q96GS4 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
BORCS6Q96GS4 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
BORCS6Q96GS4 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
BORCS6Q96GS4 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
BORCS6Q96GS4 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
BORCS6Q96GS4 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC28.41■■■□□ 2.14
BORCS6Q96GS4 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
BORCS6Q96GS4 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
BORCS6Q96GS4 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
BORCS6Q96GS4 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
BORCS6Q96GS4 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
BORCS6Q96GS4 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
BORCS6Q96GS4 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
BORCS6Q96GS4 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.14
BORCS6Q96GS4 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
BORCS6Q96GS4 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
BORCS6Q96GS4 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
BORCS6Q96GS4 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
BORCS6Q96GS4 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
BORCS6Q96GS4 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
BORCS6Q96GS4 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
BORCS6Q96GS4 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
BORCS6Q96GS4 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
BORCS6Q96GS4 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
BORCS6Q96GS4 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
BORCS6Q96GS4 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
BORCS6Q96GS4 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
BORCS6Q96GS4 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
BORCS6Q96GS4 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
BORCS6Q96GS4 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
BORCS6Q96GS4 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
BORCS6Q96GS4 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
BORCS6Q96GS4 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
BORCS6Q96GS4 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
BORCS6Q96GS4 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
BORCS6Q96GS4 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
BORCS6Q96GS4 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
BORCS6Q96GS4 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
BORCS6Q96GS4 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
BORCS6Q96GS4 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC28.27■■■□□ 2.12
BORCS6Q96GS4 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
BORCS6Q96GS4 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
BORCS6Q96GS4 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
BORCS6Q96GS4 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
BORCS6Q96GS4 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
BORCS6Q96GS4 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
BORCS6Q96GS4 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC28.24■■■□□ 2.11
BORCS6Q96GS4 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
BORCS6Q96GS4 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
BORCS6Q96GS4 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
BORCS6Q96GS4 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
BORCS6Q96GS4 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
BORCS6Q96GS4 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
BORCS6Q96GS4 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
BORCS6Q96GS4 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
BORCS6Q96GS4 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
BORCS6Q96GS4 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
BORCS6Q96GS4 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
BORCS6Q96GS4 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
BORCS6Q96GS4 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
BORCS6Q96GS4 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
BORCS6Q96GS4 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
BORCS6Q96GS4 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
BORCS6Q96GS4 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
BORCS6Q96GS4 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
BORCS6Q96GS4 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
BORCS6Q96GS4 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
BORCS6Q96GS4 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
BORCS6Q96GS4 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
BORCS6Q96GS4 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
BORCS6Q96GS4 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
BORCS6Q96GS4 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
BORCS6Q96GS4 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
BORCS6Q96GS4 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.7 ms