Protein–RNA interactions for Protein: Q96EX1

SMIM12, Small integral membrane protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM12Q96EX1 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SMIM12Q96EX1 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SMIM12Q96EX1 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SMIM12Q96EX1 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SMIM12Q96EX1 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SMIM12Q96EX1 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SMIM12Q96EX1 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
SMIM12Q96EX1 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SMIM12Q96EX1 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
SMIM12Q96EX1 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
SMIM12Q96EX1 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
SMIM12Q96EX1 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
SMIM12Q96EX1 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SMIM12Q96EX1 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.74
SMIM12Q96EX1 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
SMIM12Q96EX1 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
SMIM12Q96EX1 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
SMIM12Q96EX1 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
SMIM12Q96EX1 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
SMIM12Q96EX1 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
SMIM12Q96EX1 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC19.63■□□□□ 0.73
SMIM12Q96EX1 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SMIM12Q96EX1 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
SMIM12Q96EX1 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SMIM12Q96EX1 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
SMIM12Q96EX1 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SMIM12Q96EX1 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SMIM12Q96EX1 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SMIM12Q96EX1 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SMIM12Q96EX1 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SMIM12Q96EX1 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SMIM12Q96EX1 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SMIM12Q96EX1 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SMIM12Q96EX1 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SMIM12Q96EX1 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SMIM12Q96EX1 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SMIM12Q96EX1 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SMIM12Q96EX1 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SMIM12Q96EX1 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SMIM12Q96EX1 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SMIM12Q96EX1 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SMIM12Q96EX1 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SMIM12Q96EX1 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SMIM12Q96EX1 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SMIM12Q96EX1 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SMIM12Q96EX1 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SMIM12Q96EX1 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SMIM12Q96EX1 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SMIM12Q96EX1 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SMIM12Q96EX1 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SMIM12Q96EX1 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SMIM12Q96EX1 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SMIM12Q96EX1 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SMIM12Q96EX1 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SMIM12Q96EX1 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SMIM12Q96EX1 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SMIM12Q96EX1 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SMIM12Q96EX1 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SMIM12Q96EX1 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SMIM12Q96EX1 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SMIM12Q96EX1 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SMIM12Q96EX1 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SMIM12Q96EX1 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SMIM12Q96EX1 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SMIM12Q96EX1 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
SMIM12Q96EX1 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SMIM12Q96EX1 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SMIM12Q96EX1 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SMIM12Q96EX1 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SMIM12Q96EX1 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SMIM12Q96EX1 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SMIM12Q96EX1 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SMIM12Q96EX1 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
SMIM12Q96EX1 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
SMIM12Q96EX1 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SMIM12Q96EX1 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SMIM12Q96EX1 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SMIM12Q96EX1 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SMIM12Q96EX1 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SMIM12Q96EX1 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SMIM12Q96EX1 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SMIM12Q96EX1 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SMIM12Q96EX1 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SMIM12Q96EX1 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SMIM12Q96EX1 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SMIM12Q96EX1 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SMIM12Q96EX1 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SMIM12Q96EX1 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
SMIM12Q96EX1 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SMIM12Q96EX1 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SMIM12Q96EX1 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SMIM12Q96EX1 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SMIM12Q96EX1 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SMIM12Q96EX1 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SMIM12Q96EX1 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SMIM12Q96EX1 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
SMIM12Q96EX1 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SMIM12Q96EX1 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SMIM12Q96EX1 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SMIM12Q96EX1 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.2 ms