Protein–RNA interactions for Protein: Q96ES7

SGF29, SAGA-associated factor 29, humanhuman

Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGF29Q96ES7 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
SGF29Q96ES7 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SGF29Q96ES7 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SGF29Q96ES7 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SGF29Q96ES7 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SGF29Q96ES7 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SGF29Q96ES7 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SGF29Q96ES7 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SGF29Q96ES7 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SGF29Q96ES7 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SGF29Q96ES7 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SGF29Q96ES7 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SGF29Q96ES7 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SGF29Q96ES7 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SGF29Q96ES7 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SGF29Q96ES7 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
SGF29Q96ES7 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SGF29Q96ES7 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SGF29Q96ES7 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SGF29Q96ES7 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SGF29Q96ES7 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SGF29Q96ES7 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SGF29Q96ES7 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SGF29Q96ES7 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SGF29Q96ES7 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SGF29Q96ES7 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SGF29Q96ES7 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SGF29Q96ES7 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SGF29Q96ES7 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SGF29Q96ES7 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SGF29Q96ES7 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SGF29Q96ES7 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SGF29Q96ES7 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SGF29Q96ES7 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SGF29Q96ES7 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SGF29Q96ES7 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SGF29Q96ES7 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SGF29Q96ES7 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SGF29Q96ES7 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SGF29Q96ES7 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SGF29Q96ES7 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
SGF29Q96ES7 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
SGF29Q96ES7 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SGF29Q96ES7 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SGF29Q96ES7 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SGF29Q96ES7 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SGF29Q96ES7 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SGF29Q96ES7 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SGF29Q96ES7 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SGF29Q96ES7 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
SGF29Q96ES7 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
SGF29Q96ES7 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
SGF29Q96ES7 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
SGF29Q96ES7 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
SGF29Q96ES7 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
SGF29Q96ES7 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SGF29Q96ES7 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SGF29Q96ES7 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SGF29Q96ES7 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SGF29Q96ES7 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SGF29Q96ES7 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SGF29Q96ES7 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SGF29Q96ES7 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SGF29Q96ES7 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SGF29Q96ES7 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SGF29Q96ES7 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SGF29Q96ES7 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SGF29Q96ES7 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SGF29Q96ES7 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SGF29Q96ES7 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SGF29Q96ES7 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SGF29Q96ES7 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
SGF29Q96ES7 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
SGF29Q96ES7 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SGF29Q96ES7 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SGF29Q96ES7 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SGF29Q96ES7 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SGF29Q96ES7 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SGF29Q96ES7 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SGF29Q96ES7 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SGF29Q96ES7 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SGF29Q96ES7 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SGF29Q96ES7 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SGF29Q96ES7 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SGF29Q96ES7 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SGF29Q96ES7 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SGF29Q96ES7 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SGF29Q96ES7 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SGF29Q96ES7 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SGF29Q96ES7 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SGF29Q96ES7 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SGF29Q96ES7 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SGF29Q96ES7 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SGF29Q96ES7 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SGF29Q96ES7 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SGF29Q96ES7 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SGF29Q96ES7 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SGF29Q96ES7 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SGF29Q96ES7 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SGF29Q96ES7 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.1 ms