Protein–RNA interactions for Protein: Q96EP9

SLC10A4, Sodium/bile acid cotransporter 4, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC10A4Q96EP9 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
SLC10A4Q96EP9 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
SLC10A4Q96EP9 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.84■■■□□ 2.53
SLC10A4Q96EP9 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
SLC10A4Q96EP9 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
SLC10A4Q96EP9 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC30.83■■■□□ 2.53
SLC10A4Q96EP9 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.83■■■□□ 2.53
SLC10A4Q96EP9 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC30.83■■■□□ 2.53
SLC10A4Q96EP9 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.53
SLC10A4Q96EP9 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
SLC10A4Q96EP9 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
SLC10A4Q96EP9 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
SLC10A4Q96EP9 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
SLC10A4Q96EP9 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC30.82■■■□□ 2.52
SLC10A4Q96EP9 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC30.81■■■□□ 2.52
SLC10A4Q96EP9 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC30.8■■■□□ 2.52
SLC10A4Q96EP9 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC30.8■■■□□ 2.52
SLC10A4Q96EP9 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
SLC10A4Q96EP9 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
SLC10A4Q96EP9 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC30.78■■■□□ 2.52
SLC10A4Q96EP9 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
SLC10A4Q96EP9 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
SLC10A4Q96EP9 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
SLC10A4Q96EP9 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
SLC10A4Q96EP9 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
SLC10A4Q96EP9 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
SLC10A4Q96EP9 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC30.74■■■□□ 2.51
SLC10A4Q96EP9 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC30.74■■■□□ 2.51
SLC10A4Q96EP9 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
SLC10A4Q96EP9 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
SLC10A4Q96EP9 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.73■■■□□ 2.51
SLC10A4Q96EP9 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.72■■■□□ 2.51
SLC10A4Q96EP9 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
SLC10A4Q96EP9 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
SLC10A4Q96EP9 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
SLC10A4Q96EP9 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC30.71■■■□□ 2.51
SLC10A4Q96EP9 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC30.71■■■□□ 2.51
SLC10A4Q96EP9 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.7■■■□□ 2.51
SLC10A4Q96EP9 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
SLC10A4Q96EP9 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
SLC10A4Q96EP9 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
SLC10A4Q96EP9 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
SLC10A4Q96EP9 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
SLC10A4Q96EP9 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
SLC10A4Q96EP9 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
SLC10A4Q96EP9 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC30.68■■■□□ 2.5
SLC10A4Q96EP9 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC30.67■■■□□ 2.5
SLC10A4Q96EP9 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.67■■■□□ 2.5
SLC10A4Q96EP9 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
SLC10A4Q96EP9 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
SLC10A4Q96EP9 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC30.66■■■□□ 2.5
SLC10A4Q96EP9 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
SLC10A4Q96EP9 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
SLC10A4Q96EP9 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC30.64■■■□□ 2.5
SLC10A4Q96EP9 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
SLC10A4Q96EP9 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC30.64■■■□□ 2.5
SLC10A4Q96EP9 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
SLC10A4Q96EP9 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
SLC10A4Q96EP9 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
SLC10A4Q96EP9 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
SLC10A4Q96EP9 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.63■■■□□ 2.49
SLC10A4Q96EP9 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC30.62■■■□□ 2.49
SLC10A4Q96EP9 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
SLC10A4Q96EP9 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC30.61■■■□□ 2.49
SLC10A4Q96EP9 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC30.61■■■□□ 2.49
SLC10A4Q96EP9 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.59■■■□□ 2.49
SLC10A4Q96EP9 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
SLC10A4Q96EP9 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.59■■■□□ 2.49
SLC10A4Q96EP9 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.59■■■□□ 2.49
SLC10A4Q96EP9 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
SLC10A4Q96EP9 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC30.58■■■□□ 2.49
SLC10A4Q96EP9 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC30.58■■■□□ 2.49
SLC10A4Q96EP9 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC30.57■■■□□ 2.48
SLC10A4Q96EP9 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
SLC10A4Q96EP9 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
SLC10A4Q96EP9 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.57■■■□□ 2.48
SLC10A4Q96EP9 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
SLC10A4Q96EP9 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
SLC10A4Q96EP9 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
SLC10A4Q96EP9 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
SLC10A4Q96EP9 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
SLC10A4Q96EP9 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC30.54■■■□□ 2.48
SLC10A4Q96EP9 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC30.54■■■□□ 2.48
SLC10A4Q96EP9 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
SLC10A4Q96EP9 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC30.53■■■□□ 2.48
SLC10A4Q96EP9 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
SLC10A4Q96EP9 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
SLC10A4Q96EP9 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.48
SLC10A4Q96EP9 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC30.51■■■□□ 2.47
SLC10A4Q96EP9 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
SLC10A4Q96EP9 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
SLC10A4Q96EP9 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
SLC10A4Q96EP9 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC30.5■■■□□ 2.47
SLC10A4Q96EP9 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
SLC10A4Q96EP9 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC30.5■■■□□ 2.47
SLC10A4Q96EP9 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.5■■■□□ 2.47
SLC10A4Q96EP9 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC30.49■■■□□ 2.47
SLC10A4Q96EP9 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC30.49■■■□□ 2.47
SLC10A4Q96EP9 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
SLC10A4Q96EP9 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.48■■■□□ 2.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 242.4 ms