Protein–RNA interactions for Protein: Q96EC8

YIPF6, Protein YIPF6, humanhuman

Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YIPF6Q96EC8 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
YIPF6Q96EC8 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
YIPF6Q96EC8 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
YIPF6Q96EC8 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
YIPF6Q96EC8 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
YIPF6Q96EC8 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
YIPF6Q96EC8 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
YIPF6Q96EC8 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
YIPF6Q96EC8 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
YIPF6Q96EC8 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
YIPF6Q96EC8 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
YIPF6Q96EC8 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
YIPF6Q96EC8 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
YIPF6Q96EC8 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
YIPF6Q96EC8 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
YIPF6Q96EC8 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
YIPF6Q96EC8 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
YIPF6Q96EC8 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
YIPF6Q96EC8 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
YIPF6Q96EC8 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
YIPF6Q96EC8 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
YIPF6Q96EC8 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
YIPF6Q96EC8 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
YIPF6Q96EC8 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
YIPF6Q96EC8 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
YIPF6Q96EC8 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
YIPF6Q96EC8 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
YIPF6Q96EC8 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
YIPF6Q96EC8 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
YIPF6Q96EC8 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
YIPF6Q96EC8 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
YIPF6Q96EC8 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
YIPF6Q96EC8 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
YIPF6Q96EC8 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
YIPF6Q96EC8 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
YIPF6Q96EC8 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
YIPF6Q96EC8 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
YIPF6Q96EC8 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
YIPF6Q96EC8 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
YIPF6Q96EC8 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
YIPF6Q96EC8 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
YIPF6Q96EC8 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
YIPF6Q96EC8 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
YIPF6Q96EC8 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
YIPF6Q96EC8 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
YIPF6Q96EC8 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
YIPF6Q96EC8 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
YIPF6Q96EC8 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
YIPF6Q96EC8 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
YIPF6Q96EC8 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
YIPF6Q96EC8 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
YIPF6Q96EC8 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
YIPF6Q96EC8 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
YIPF6Q96EC8 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
YIPF6Q96EC8 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
YIPF6Q96EC8 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
YIPF6Q96EC8 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
YIPF6Q96EC8 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
YIPF6Q96EC8 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
YIPF6Q96EC8 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
YIPF6Q96EC8 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
YIPF6Q96EC8 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
YIPF6Q96EC8 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
YIPF6Q96EC8 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
YIPF6Q96EC8 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
YIPF6Q96EC8 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
YIPF6Q96EC8 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
YIPF6Q96EC8 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
YIPF6Q96EC8 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
YIPF6Q96EC8 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
YIPF6Q96EC8 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
YIPF6Q96EC8 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
YIPF6Q96EC8 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
YIPF6Q96EC8 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
YIPF6Q96EC8 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
YIPF6Q96EC8 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
YIPF6Q96EC8 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
YIPF6Q96EC8 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
YIPF6Q96EC8 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
YIPF6Q96EC8 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
YIPF6Q96EC8 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
YIPF6Q96EC8 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
YIPF6Q96EC8 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
YIPF6Q96EC8 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
YIPF6Q96EC8 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
YIPF6Q96EC8 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
YIPF6Q96EC8 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
YIPF6Q96EC8 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
YIPF6Q96EC8 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
YIPF6Q96EC8 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
YIPF6Q96EC8 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
YIPF6Q96EC8 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
YIPF6Q96EC8 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
YIPF6Q96EC8 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
YIPF6Q96EC8 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
YIPF6Q96EC8 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
YIPF6Q96EC8 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
YIPF6Q96EC8 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
YIPF6Q96EC8 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
YIPF6Q96EC8 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms