Protein–RNA interactions for Protein: Q96DN6

MBD6, Methyl-CpG-binding domain protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 1,003 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MBD6Q96DN6 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MBD6Q96DN6 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MBD6Q96DN6 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MBD6Q96DN6 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MBD6Q96DN6 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MBD6Q96DN6 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MBD6Q96DN6 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MBD6Q96DN6 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MBD6Q96DN6 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MBD6Q96DN6 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MBD6Q96DN6 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MBD6Q96DN6 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MBD6Q96DN6 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MBD6Q96DN6 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MBD6Q96DN6 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MBD6Q96DN6 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MBD6Q96DN6 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MBD6Q96DN6 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MBD6Q96DN6 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
MBD6Q96DN6 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MBD6Q96DN6 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MBD6Q96DN6 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MBD6Q96DN6 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MBD6Q96DN6 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MBD6Q96DN6 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MBD6Q96DN6 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
MBD6Q96DN6 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MBD6Q96DN6 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MBD6Q96DN6 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MBD6Q96DN6 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MBD6Q96DN6 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MBD6Q96DN6 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
MBD6Q96DN6 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
MBD6Q96DN6 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
MBD6Q96DN6 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
MBD6Q96DN6 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MBD6Q96DN6 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MBD6Q96DN6 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MBD6Q96DN6 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MBD6Q96DN6 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MBD6Q96DN6 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MBD6Q96DN6 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MBD6Q96DN6 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MBD6Q96DN6 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MBD6Q96DN6 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
MBD6Q96DN6 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MBD6Q96DN6 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MBD6Q96DN6 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MBD6Q96DN6 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MBD6Q96DN6 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MBD6Q96DN6 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MBD6Q96DN6 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MBD6Q96DN6 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MBD6Q96DN6 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MBD6Q96DN6 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MBD6Q96DN6 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MBD6Q96DN6 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MBD6Q96DN6 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
MBD6Q96DN6 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MBD6Q96DN6 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MBD6Q96DN6 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MBD6Q96DN6 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MBD6Q96DN6 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MBD6Q96DN6 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MBD6Q96DN6 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MBD6Q96DN6 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MBD6Q96DN6 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
MBD6Q96DN6 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MBD6Q96DN6 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MBD6Q96DN6 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MBD6Q96DN6 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MBD6Q96DN6 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MBD6Q96DN6 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MBD6Q96DN6 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MBD6Q96DN6 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MBD6Q96DN6 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MBD6Q96DN6 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MBD6Q96DN6 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MBD6Q96DN6 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MBD6Q96DN6 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MBD6Q96DN6 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MBD6Q96DN6 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
MBD6Q96DN6 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MBD6Q96DN6 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MBD6Q96DN6 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MBD6Q96DN6 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MBD6Q96DN6 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MBD6Q96DN6 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MBD6Q96DN6 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
MBD6Q96DN6 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MBD6Q96DN6 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MBD6Q96DN6 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
MBD6Q96DN6 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MBD6Q96DN6 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MBD6Q96DN6 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
MBD6Q96DN6 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MBD6Q96DN6 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MBD6Q96DN6 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MBD6Q96DN6 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MBD6Q96DN6 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.5 ms