Protein–RNA interactions for Protein: Q96CP7

TLCD1, Calfacilitin, humanhuman

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TLCD1Q96CP7 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TLCD1Q96CP7 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TLCD1Q96CP7 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
TLCD1Q96CP7 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
TLCD1Q96CP7 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
TLCD1Q96CP7 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TLCD1Q96CP7 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
TLCD1Q96CP7 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TLCD1Q96CP7 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
TLCD1Q96CP7 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
TLCD1Q96CP7 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
TLCD1Q96CP7 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
TLCD1Q96CP7 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TLCD1Q96CP7 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
TLCD1Q96CP7 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TLCD1Q96CP7 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
TLCD1Q96CP7 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
TLCD1Q96CP7 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TLCD1Q96CP7 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
TLCD1Q96CP7 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TLCD1Q96CP7 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
TLCD1Q96CP7 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
TLCD1Q96CP7 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TLCD1Q96CP7 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
TLCD1Q96CP7 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
TLCD1Q96CP7 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TLCD1Q96CP7 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TLCD1Q96CP7 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TLCD1Q96CP7 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
TLCD1Q96CP7 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TLCD1Q96CP7 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TLCD1Q96CP7 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
TLCD1Q96CP7 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
TLCD1Q96CP7 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
TLCD1Q96CP7 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
TLCD1Q96CP7 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.77
TLCD1Q96CP7 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
TLCD1Q96CP7 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
TLCD1Q96CP7 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC26.14■■□□□ 1.77
TLCD1Q96CP7 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TLCD1Q96CP7 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TLCD1Q96CP7 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TLCD1Q96CP7 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TLCD1Q96CP7 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TLCD1Q96CP7 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TLCD1Q96CP7 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TLCD1Q96CP7 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TLCD1Q96CP7 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
TLCD1Q96CP7 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TLCD1Q96CP7 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
TLCD1Q96CP7 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TLCD1Q96CP7 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TLCD1Q96CP7 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
TLCD1Q96CP7 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
TLCD1Q96CP7 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
TLCD1Q96CP7 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
TLCD1Q96CP7 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TLCD1Q96CP7 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
TLCD1Q96CP7 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TLCD1Q96CP7 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TLCD1Q96CP7 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
TLCD1Q96CP7 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TLCD1Q96CP7 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TLCD1Q96CP7 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
TLCD1Q96CP7 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TLCD1Q96CP7 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TLCD1Q96CP7 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TLCD1Q96CP7 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TLCD1Q96CP7 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TLCD1Q96CP7 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TLCD1Q96CP7 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TLCD1Q96CP7 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TLCD1Q96CP7 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TLCD1Q96CP7 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
TLCD1Q96CP7 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TLCD1Q96CP7 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TLCD1Q96CP7 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TLCD1Q96CP7 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TLCD1Q96CP7 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
TLCD1Q96CP7 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
TLCD1Q96CP7 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TLCD1Q96CP7 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
TLCD1Q96CP7 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
TLCD1Q96CP7 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
TLCD1Q96CP7 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TLCD1Q96CP7 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
TLCD1Q96CP7 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TLCD1Q96CP7 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TLCD1Q96CP7 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
TLCD1Q96CP7 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
TLCD1Q96CP7 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TLCD1Q96CP7 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TLCD1Q96CP7 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TLCD1Q96CP7 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
TLCD1Q96CP7 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TLCD1Q96CP7 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TLCD1Q96CP7 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TLCD1Q96CP7 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TLCD1Q96CP7 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TLCD1Q96CP7 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms