Protein–RNA interactions for Protein: Q96CN9

GCC1, GRIP and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 775 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCC1Q96CN9 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC32.43■■■□□ 2.78
GCC1Q96CN9 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC32.43■■■□□ 2.78
GCC1Q96CN9 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
GCC1Q96CN9 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC32.42■■■□□ 2.78
GCC1Q96CN9 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
GCC1Q96CN9 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC32.4■■■□□ 2.78
GCC1Q96CN9 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC32.4■■■□□ 2.78
GCC1Q96CN9 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
GCC1Q96CN9 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
GCC1Q96CN9 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
GCC1Q96CN9 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.39■■■□□ 2.78
GCC1Q96CN9 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC32.38■■■□□ 2.77
GCC1Q96CN9 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
GCC1Q96CN9 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
GCC1Q96CN9 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
GCC1Q96CN9 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
GCC1Q96CN9 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
GCC1Q96CN9 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
GCC1Q96CN9 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
GCC1Q96CN9 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC32.33■■■□□ 2.77
GCC1Q96CN9 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC32.33■■■□□ 2.77
GCC1Q96CN9 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
GCC1Q96CN9 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC32.32■■■□□ 2.76
GCC1Q96CN9 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC32.31■■■□□ 2.76
GCC1Q96CN9 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC32.31■■■□□ 2.76
GCC1Q96CN9 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
GCC1Q96CN9 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC32.3■■■□□ 2.76
GCC1Q96CN9 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
GCC1Q96CN9 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
GCC1Q96CN9 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC32.29■■■□□ 2.76
GCC1Q96CN9 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
GCC1Q96CN9 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC32.27■■■□□ 2.76
GCC1Q96CN9 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
GCC1Q96CN9 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
GCC1Q96CN9 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.27■■■□□ 2.76
GCC1Q96CN9 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC32.27■■■□□ 2.76
GCC1Q96CN9 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
GCC1Q96CN9 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC32.27■■■□□ 2.76
GCC1Q96CN9 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC32.26■■■□□ 2.75
GCC1Q96CN9 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC32.26■■■□□ 2.75
GCC1Q96CN9 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC32.25■■■□□ 2.75
GCC1Q96CN9 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
GCC1Q96CN9 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
GCC1Q96CN9 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC32.24■■■□□ 2.75
GCC1Q96CN9 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.24■■■□□ 2.75
GCC1Q96CN9 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC32.24■■■□□ 2.75
GCC1Q96CN9 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
GCC1Q96CN9 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC32.23■■■□□ 2.75
GCC1Q96CN9 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.23■■■□□ 2.75
GCC1Q96CN9 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
GCC1Q96CN9 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
GCC1Q96CN9 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
GCC1Q96CN9 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC32.22■■■□□ 2.75
GCC1Q96CN9 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC32.22■■■□□ 2.75
GCC1Q96CN9 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.22■■■□□ 2.75
GCC1Q96CN9 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC32.21■■■□□ 2.75
GCC1Q96CN9 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC32.2■■■□□ 2.75
GCC1Q96CN9 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.74
GCC1Q96CN9 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC32.2■■■□□ 2.74
GCC1Q96CN9 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC32.19■■■□□ 2.74
GCC1Q96CN9 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC32.19■■■□□ 2.74
GCC1Q96CN9 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
GCC1Q96CN9 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC32.18■■■□□ 2.74
GCC1Q96CN9 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC32.18■■■□□ 2.74
GCC1Q96CN9 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC32.17■■■□□ 2.74
GCC1Q96CN9 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
GCC1Q96CN9 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC32.16■■■□□ 2.74
GCC1Q96CN9 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC32.16■■■□□ 2.74
GCC1Q96CN9 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
GCC1Q96CN9 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
GCC1Q96CN9 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC32.15■■■□□ 2.74
GCC1Q96CN9 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
GCC1Q96CN9 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC32.15■■■□□ 2.74
GCC1Q96CN9 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
GCC1Q96CN9 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC32.15■■■□□ 2.74
GCC1Q96CN9 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
GCC1Q96CN9 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
GCC1Q96CN9 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
GCC1Q96CN9 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.14■■■□□ 2.74
GCC1Q96CN9 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
GCC1Q96CN9 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
GCC1Q96CN9 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC32.12■■■□□ 2.73
GCC1Q96CN9 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.12■■■□□ 2.73
GCC1Q96CN9 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
GCC1Q96CN9 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC32.12■■■□□ 2.73
GCC1Q96CN9 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
GCC1Q96CN9 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC32.11■■■□□ 2.73
GCC1Q96CN9 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.1■■■□□ 2.73
GCC1Q96CN9 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC32.09■■■□□ 2.73
GCC1Q96CN9 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
GCC1Q96CN9 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC32.09■■■□□ 2.73
GCC1Q96CN9 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
GCC1Q96CN9 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
GCC1Q96CN9 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
GCC1Q96CN9 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
GCC1Q96CN9 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
GCC1Q96CN9 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
GCC1Q96CN9 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC32.08■■■□□ 2.73
GCC1Q96CN9 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.08■■■□□ 2.73
GCC1Q96CN9 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC32.08■■■□□ 2.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms