Protein–RNA interactions for Protein: Q96C74

ROPN1L, Ropporin-1-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ROPN1LQ96C74 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ROPN1LQ96C74 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ROPN1LQ96C74 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ROPN1LQ96C74 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ROPN1LQ96C74 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ROPN1LQ96C74 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ROPN1LQ96C74 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ROPN1LQ96C74 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ROPN1LQ96C74 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ROPN1LQ96C74 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ROPN1LQ96C74 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ROPN1LQ96C74 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ROPN1LQ96C74 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ROPN1LQ96C74 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ROPN1LQ96C74 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ROPN1LQ96C74 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ROPN1LQ96C74 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ROPN1LQ96C74 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
ROPN1LQ96C74 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ROPN1LQ96C74 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ROPN1LQ96C74 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ROPN1LQ96C74 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ROPN1LQ96C74 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ROPN1LQ96C74 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ROPN1LQ96C74 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ROPN1LQ96C74 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ROPN1LQ96C74 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ROPN1LQ96C74 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ROPN1LQ96C74 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ROPN1LQ96C74 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ROPN1LQ96C74 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ROPN1LQ96C74 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ROPN1LQ96C74 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ROPN1LQ96C74 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ROPN1LQ96C74 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ROPN1LQ96C74 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ROPN1LQ96C74 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ROPN1LQ96C74 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ROPN1LQ96C74 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ROPN1LQ96C74 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ROPN1LQ96C74 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ROPN1LQ96C74 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ROPN1LQ96C74 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ROPN1LQ96C74 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ROPN1LQ96C74 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ROPN1LQ96C74 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ROPN1LQ96C74 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ROPN1LQ96C74 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
ROPN1LQ96C74 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ROPN1LQ96C74 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ROPN1LQ96C74 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ROPN1LQ96C74 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ROPN1LQ96C74 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ROPN1LQ96C74 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ROPN1LQ96C74 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ROPN1LQ96C74 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ROPN1LQ96C74 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ROPN1LQ96C74 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ROPN1LQ96C74 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ROPN1LQ96C74 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ROPN1LQ96C74 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ROPN1LQ96C74 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ROPN1LQ96C74 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ROPN1LQ96C74 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ROPN1LQ96C74 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ROPN1LQ96C74 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ROPN1LQ96C74 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ROPN1LQ96C74 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ROPN1LQ96C74 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ROPN1LQ96C74 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ROPN1LQ96C74 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ROPN1LQ96C74 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ROPN1LQ96C74 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ROPN1LQ96C74 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ROPN1LQ96C74 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ROPN1LQ96C74 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ROPN1LQ96C74 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ROPN1LQ96C74 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ROPN1LQ96C74 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ROPN1LQ96C74 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ROPN1LQ96C74 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ROPN1LQ96C74 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ROPN1LQ96C74 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ROPN1LQ96C74 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ROPN1LQ96C74 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ROPN1LQ96C74 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ROPN1LQ96C74 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ROPN1LQ96C74 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ROPN1LQ96C74 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ROPN1LQ96C74 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ROPN1LQ96C74 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ROPN1LQ96C74 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ROPN1LQ96C74 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ROPN1LQ96C74 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
ROPN1LQ96C74 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ROPN1LQ96C74 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ROPN1LQ96C74 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
ROPN1LQ96C74 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
ROPN1LQ96C74 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ROPN1LQ96C74 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 104.5 ms