Protein–RNA interactions for Protein: Q96C45

ULK4, Serine/threonine-protein kinase ULK4, humanhuman

Predictions only

Length 1,275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ULK4Q96C45 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
ULK4Q96C45 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
ULK4Q96C45 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
ULK4Q96C45 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
ULK4Q96C45 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC25.83■■□□□ 1.72
ULK4Q96C45 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
ULK4Q96C45 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ULK4Q96C45 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ULK4Q96C45 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
ULK4Q96C45 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ULK4Q96C45 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ULK4Q96C45 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
ULK4Q96C45 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ULK4Q96C45 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
ULK4Q96C45 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ULK4Q96C45 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ULK4Q96C45 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
ULK4Q96C45 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ULK4Q96C45 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ULK4Q96C45 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC25.79■■□□□ 1.72
ULK4Q96C45 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ULK4Q96C45 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
ULK4Q96C45 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ULK4Q96C45 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ULK4Q96C45 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ULK4Q96C45 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
ULK4Q96C45 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
ULK4Q96C45 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
ULK4Q96C45 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
ULK4Q96C45 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ULK4Q96C45 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ULK4Q96C45 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ULK4Q96C45 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ULK4Q96C45 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ULK4Q96C45 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ULK4Q96C45 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ULK4Q96C45 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ULK4Q96C45 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
ULK4Q96C45 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ULK4Q96C45 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ULK4Q96C45 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ULK4Q96C45 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC25.71■■□□□ 1.71
ULK4Q96C45 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
ULK4Q96C45 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ULK4Q96C45 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
ULK4Q96C45 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
ULK4Q96C45 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ULK4Q96C45 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ULK4Q96C45 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
ULK4Q96C45 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ULK4Q96C45 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ULK4Q96C45 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ULK4Q96C45 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
ULK4Q96C45 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
ULK4Q96C45 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
ULK4Q96C45 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ULK4Q96C45 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
ULK4Q96C45 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
ULK4Q96C45 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
ULK4Q96C45 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
ULK4Q96C45 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
ULK4Q96C45 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
ULK4Q96C45 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
ULK4Q96C45 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC25.64■■□□□ 1.69
ULK4Q96C45 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
ULK4Q96C45 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
ULK4Q96C45 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ULK4Q96C45 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
ULK4Q96C45 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
ULK4Q96C45 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
ULK4Q96C45 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ULK4Q96C45 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ULK4Q96C45 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
ULK4Q96C45 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
ULK4Q96C45 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
ULK4Q96C45 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
ULK4Q96C45 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ULK4Q96C45 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
ULK4Q96C45 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
ULK4Q96C45 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC25.6■■□□□ 1.69
ULK4Q96C45 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
ULK4Q96C45 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ULK4Q96C45 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ULK4Q96C45 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
ULK4Q96C45 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
ULK4Q96C45 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ULK4Q96C45 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ULK4Q96C45 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
ULK4Q96C45 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
ULK4Q96C45 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
ULK4Q96C45 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ULK4Q96C45 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ULK4Q96C45 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ULK4Q96C45 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ULK4Q96C45 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ULK4Q96C45 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ULK4Q96C45 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ULK4Q96C45 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ULK4Q96C45 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ULK4Q96C45 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms