Protein–RNA interactions for Protein: Q96BT3

CENPT, Centromere protein T, humanhuman

Predictions only

Length 561 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPTQ96BT3 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CENPTQ96BT3 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CENPTQ96BT3 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CENPTQ96BT3 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
CENPTQ96BT3 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CENPTQ96BT3 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CENPTQ96BT3 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CENPTQ96BT3 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CENPTQ96BT3 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CENPTQ96BT3 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CENPTQ96BT3 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CENPTQ96BT3 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CENPTQ96BT3 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CENPTQ96BT3 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CENPTQ96BT3 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CENPTQ96BT3 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CENPTQ96BT3 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CENPTQ96BT3 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CENPTQ96BT3 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CENPTQ96BT3 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CENPTQ96BT3 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CENPTQ96BT3 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CENPTQ96BT3 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CENPTQ96BT3 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CENPTQ96BT3 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CENPTQ96BT3 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CENPTQ96BT3 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CENPTQ96BT3 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CENPTQ96BT3 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
CENPTQ96BT3 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CENPTQ96BT3 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CENPTQ96BT3 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
CENPTQ96BT3 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CENPTQ96BT3 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CENPTQ96BT3 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CENPTQ96BT3 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CENPTQ96BT3 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CENPTQ96BT3 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CENPTQ96BT3 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CENPTQ96BT3 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CENPTQ96BT3 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CENPTQ96BT3 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CENPTQ96BT3 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CENPTQ96BT3 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CENPTQ96BT3 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CENPTQ96BT3 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CENPTQ96BT3 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CENPTQ96BT3 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CENPTQ96BT3 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CENPTQ96BT3 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
CENPTQ96BT3 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
CENPTQ96BT3 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CENPTQ96BT3 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CENPTQ96BT3 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CENPTQ96BT3 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CENPTQ96BT3 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CENPTQ96BT3 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CENPTQ96BT3 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CENPTQ96BT3 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CENPTQ96BT3 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CENPTQ96BT3 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CENPTQ96BT3 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CENPTQ96BT3 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CENPTQ96BT3 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CENPTQ96BT3 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CENPTQ96BT3 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
CENPTQ96BT3 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CENPTQ96BT3 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CENPTQ96BT3 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CENPTQ96BT3 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CENPTQ96BT3 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CENPTQ96BT3 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CENPTQ96BT3 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CENPTQ96BT3 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CENPTQ96BT3 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.84
CENPTQ96BT3 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CENPTQ96BT3 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CENPTQ96BT3 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
CENPTQ96BT3 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CENPTQ96BT3 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CENPTQ96BT3 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CENPTQ96BT3 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CENPTQ96BT3 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CENPTQ96BT3 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CENPTQ96BT3 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CENPTQ96BT3 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
CENPTQ96BT3 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CENPTQ96BT3 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CENPTQ96BT3 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CENPTQ96BT3 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CENPTQ96BT3 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CENPTQ96BT3 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CENPTQ96BT3 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
CENPTQ96BT3 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CENPTQ96BT3 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CENPTQ96BT3 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CENPTQ96BT3 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CENPTQ96BT3 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CENPTQ96BT3 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CENPTQ96BT3 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.7 ms