Protein–RNA interactions for Protein: Q96BQ1

FAM3D, Protein FAM3D, humanhuman

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Length 224 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3DQ96BQ1 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
FAM3DQ96BQ1 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
FAM3DQ96BQ1 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FAM3DQ96BQ1 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FAM3DQ96BQ1 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
FAM3DQ96BQ1 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
FAM3DQ96BQ1 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
FAM3DQ96BQ1 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FAM3DQ96BQ1 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
FAM3DQ96BQ1 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FAM3DQ96BQ1 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FAM3DQ96BQ1 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FAM3DQ96BQ1 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
FAM3DQ96BQ1 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FAM3DQ96BQ1 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
FAM3DQ96BQ1 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FAM3DQ96BQ1 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FAM3DQ96BQ1 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FAM3DQ96BQ1 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FAM3DQ96BQ1 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
FAM3DQ96BQ1 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FAM3DQ96BQ1 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FAM3DQ96BQ1 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
FAM3DQ96BQ1 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
FAM3DQ96BQ1 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
FAM3DQ96BQ1 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
FAM3DQ96BQ1 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
FAM3DQ96BQ1 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
FAM3DQ96BQ1 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FAM3DQ96BQ1 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FAM3DQ96BQ1 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
FAM3DQ96BQ1 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
FAM3DQ96BQ1 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
FAM3DQ96BQ1 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
FAM3DQ96BQ1 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FAM3DQ96BQ1 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FAM3DQ96BQ1 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FAM3DQ96BQ1 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
FAM3DQ96BQ1 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FAM3DQ96BQ1 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
FAM3DQ96BQ1 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FAM3DQ96BQ1 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FAM3DQ96BQ1 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FAM3DQ96BQ1 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FAM3DQ96BQ1 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FAM3DQ96BQ1 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
FAM3DQ96BQ1 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FAM3DQ96BQ1 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
FAM3DQ96BQ1 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FAM3DQ96BQ1 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
FAM3DQ96BQ1 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
FAM3DQ96BQ1 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
FAM3DQ96BQ1 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FAM3DQ96BQ1 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FAM3DQ96BQ1 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FAM3DQ96BQ1 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
FAM3DQ96BQ1 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FAM3DQ96BQ1 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FAM3DQ96BQ1 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FAM3DQ96BQ1 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FAM3DQ96BQ1 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FAM3DQ96BQ1 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FAM3DQ96BQ1 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FAM3DQ96BQ1 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FAM3DQ96BQ1 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FAM3DQ96BQ1 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FAM3DQ96BQ1 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FAM3DQ96BQ1 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FAM3DQ96BQ1 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FAM3DQ96BQ1 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FAM3DQ96BQ1 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
FAM3DQ96BQ1 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
FAM3DQ96BQ1 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
FAM3DQ96BQ1 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
FAM3DQ96BQ1 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
FAM3DQ96BQ1 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FAM3DQ96BQ1 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FAM3DQ96BQ1 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FAM3DQ96BQ1 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FAM3DQ96BQ1 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FAM3DQ96BQ1 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FAM3DQ96BQ1 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FAM3DQ96BQ1 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FAM3DQ96BQ1 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FAM3DQ96BQ1 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FAM3DQ96BQ1 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FAM3DQ96BQ1 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FAM3DQ96BQ1 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FAM3DQ96BQ1 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FAM3DQ96BQ1 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FAM3DQ96BQ1 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FAM3DQ96BQ1 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FAM3DQ96BQ1 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FAM3DQ96BQ1 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FAM3DQ96BQ1 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FAM3DQ96BQ1 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FAM3DQ96BQ1 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FAM3DQ96BQ1 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FAM3DQ96BQ1 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
FAM3DQ96BQ1 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
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