Protein–RNA interactions for Protein: Q96A09

FAM46B, Putative nucleotidyltransferase FAM46B, humanhuman

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM46BQ96A09 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
FAM46BQ96A09 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
FAM46BQ96A09 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
FAM46BQ96A09 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FAM46BQ96A09 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FAM46BQ96A09 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FAM46BQ96A09 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FAM46BQ96A09 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FAM46BQ96A09 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FAM46BQ96A09 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FAM46BQ96A09 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FAM46BQ96A09 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FAM46BQ96A09 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FAM46BQ96A09 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FAM46BQ96A09 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FAM46BQ96A09 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
FAM46BQ96A09 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
FAM46BQ96A09 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FAM46BQ96A09 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FAM46BQ96A09 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FAM46BQ96A09 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FAM46BQ96A09 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FAM46BQ96A09 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FAM46BQ96A09 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FAM46BQ96A09 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FAM46BQ96A09 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FAM46BQ96A09 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FAM46BQ96A09 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FAM46BQ96A09 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FAM46BQ96A09 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FAM46BQ96A09 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FAM46BQ96A09 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FAM46BQ96A09 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FAM46BQ96A09 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FAM46BQ96A09 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FAM46BQ96A09 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
FAM46BQ96A09 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
FAM46BQ96A09 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
FAM46BQ96A09 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
FAM46BQ96A09 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FAM46BQ96A09 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FAM46BQ96A09 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FAM46BQ96A09 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FAM46BQ96A09 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FAM46BQ96A09 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FAM46BQ96A09 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
FAM46BQ96A09 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FAM46BQ96A09 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FAM46BQ96A09 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FAM46BQ96A09 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FAM46BQ96A09 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FAM46BQ96A09 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FAM46BQ96A09 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FAM46BQ96A09 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FAM46BQ96A09 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FAM46BQ96A09 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FAM46BQ96A09 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FAM46BQ96A09 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FAM46BQ96A09 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FAM46BQ96A09 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FAM46BQ96A09 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FAM46BQ96A09 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FAM46BQ96A09 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FAM46BQ96A09 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FAM46BQ96A09 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FAM46BQ96A09 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FAM46BQ96A09 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FAM46BQ96A09 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FAM46BQ96A09 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
FAM46BQ96A09 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FAM46BQ96A09 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FAM46BQ96A09 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FAM46BQ96A09 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
FAM46BQ96A09 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
FAM46BQ96A09 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
FAM46BQ96A09 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
FAM46BQ96A09 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
FAM46BQ96A09 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FAM46BQ96A09 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FAM46BQ96A09 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FAM46BQ96A09 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FAM46BQ96A09 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FAM46BQ96A09 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FAM46BQ96A09 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FAM46BQ96A09 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FAM46BQ96A09 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FAM46BQ96A09 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FAM46BQ96A09 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FAM46BQ96A09 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
FAM46BQ96A09 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FAM46BQ96A09 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FAM46BQ96A09 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FAM46BQ96A09 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FAM46BQ96A09 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FAM46BQ96A09 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FAM46BQ96A09 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FAM46BQ96A09 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FAM46BQ96A09 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FAM46BQ96A09 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FAM46BQ96A09 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms