Protein–RNA interactions for Protein: Q969X1

TMBIM1, Protein lifeguard 3, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMBIM1Q969X1 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TMBIM1Q969X1 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TMBIM1Q969X1 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TMBIM1Q969X1 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TMBIM1Q969X1 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TMBIM1Q969X1 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TMBIM1Q969X1 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TMBIM1Q969X1 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
TMBIM1Q969X1 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TMBIM1Q969X1 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TMBIM1Q969X1 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TMBIM1Q969X1 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TMBIM1Q969X1 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
TMBIM1Q969X1 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TMBIM1Q969X1 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
TMBIM1Q969X1 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TMBIM1Q969X1 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TMBIM1Q969X1 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TMBIM1Q969X1 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TMBIM1Q969X1 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TMBIM1Q969X1 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TMBIM1Q969X1 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
TMBIM1Q969X1 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TMBIM1Q969X1 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TMBIM1Q969X1 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TMBIM1Q969X1 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TMBIM1Q969X1 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TMBIM1Q969X1 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TMBIM1Q969X1 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TMBIM1Q969X1 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TMBIM1Q969X1 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TMBIM1Q969X1 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
TMBIM1Q969X1 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TMBIM1Q969X1 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TMBIM1Q969X1 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TMBIM1Q969X1 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TMBIM1Q969X1 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TMBIM1Q969X1 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TMBIM1Q969X1 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TMBIM1Q969X1 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TMBIM1Q969X1 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TMBIM1Q969X1 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TMBIM1Q969X1 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TMBIM1Q969X1 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TMBIM1Q969X1 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TMBIM1Q969X1 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TMBIM1Q969X1 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
TMBIM1Q969X1 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TMBIM1Q969X1 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
TMBIM1Q969X1 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TMBIM1Q969X1 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TMBIM1Q969X1 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TMBIM1Q969X1 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TMBIM1Q969X1 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TMBIM1Q969X1 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TMBIM1Q969X1 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
TMBIM1Q969X1 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TMBIM1Q969X1 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TMBIM1Q969X1 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TMBIM1Q969X1 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TMBIM1Q969X1 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TMBIM1Q969X1 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TMBIM1Q969X1 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TMBIM1Q969X1 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TMBIM1Q969X1 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TMBIM1Q969X1 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TMBIM1Q969X1 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TMBIM1Q969X1 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TMBIM1Q969X1 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TMBIM1Q969X1 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
TMBIM1Q969X1 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TMBIM1Q969X1 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TMBIM1Q969X1 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TMBIM1Q969X1 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TMBIM1Q969X1 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TMBIM1Q969X1 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TMBIM1Q969X1 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TMBIM1Q969X1 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TMBIM1Q969X1 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TMBIM1Q969X1 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TMBIM1Q969X1 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TMBIM1Q969X1 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TMBIM1Q969X1 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TMBIM1Q969X1 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TMBIM1Q969X1 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TMBIM1Q969X1 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TMBIM1Q969X1 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
TMBIM1Q969X1 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TMBIM1Q969X1 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TMBIM1Q969X1 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TMBIM1Q969X1 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TMBIM1Q969X1 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TMBIM1Q969X1 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TMBIM1Q969X1 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TMBIM1Q969X1 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TMBIM1Q969X1 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TMBIM1Q969X1 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TMBIM1Q969X1 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TMBIM1Q969X1 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TMBIM1Q969X1 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.3 ms