Protein–RNA interactions for Protein: Q93074

MED12, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 12, humanhuman

Predictions only

Length 2,177 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED12Q93074 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MED12Q93074 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MED12Q93074 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MED12Q93074 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MED12Q93074 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
MED12Q93074 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
MED12Q93074 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
MED12Q93074 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
MED12Q93074 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
MED12Q93074 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
MED12Q93074 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
MED12Q93074 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
MED12Q93074 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MED12Q93074 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MED12Q93074 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MED12Q93074 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MED12Q93074 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MED12Q93074 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MED12Q93074 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MED12Q93074 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MED12Q93074 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MED12Q93074 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MED12Q93074 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.35
MED12Q93074 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MED12Q93074 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
MED12Q93074 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MED12Q93074 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
MED12Q93074 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MED12Q93074 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
MED12Q93074 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
MED12Q93074 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MED12Q93074 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
MED12Q93074 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MED12Q93074 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
MED12Q93074 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
MED12Q93074 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MED12Q93074 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MED12Q93074 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
MED12Q93074 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MED12Q93074 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MED12Q93074 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MED12Q93074 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
MED12Q93074 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
MED12Q93074 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
MED12Q93074 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MED12Q93074 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MED12Q93074 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
MED12Q93074 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MED12Q93074 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
MED12Q93074 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MED12Q93074 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
MED12Q93074 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MED12Q93074 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
MED12Q93074 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
MED12Q93074 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
MED12Q93074 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
MED12Q93074 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
MED12Q93074 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
MED12Q93074 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MED12Q93074 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MED12Q93074 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
MED12Q93074 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC23.37■■□□□ 1.33
MED12Q93074 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MED12Q93074 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MED12Q93074 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
MED12Q93074 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
MED12Q93074 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
MED12Q93074 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
MED12Q93074 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
MED12Q93074 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
MED12Q93074 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
MED12Q93074 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MED12Q93074 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
MED12Q93074 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MED12Q93074 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MED12Q93074 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC23.35■■□□□ 1.33
MED12Q93074 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MED12Q93074 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
MED12Q93074 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
MED12Q93074 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
MED12Q93074 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
MED12Q93074 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
MED12Q93074 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MED12Q93074 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MED12Q93074 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MED12Q93074 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
MED12Q93074 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
MED12Q93074 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
MED12Q93074 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
MED12Q93074 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
MED12Q93074 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
MED12Q93074 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
MED12Q93074 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
MED12Q93074 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
MED12Q93074 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
MED12Q93074 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
MED12Q93074 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
MED12Q93074 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
MED12Q93074 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
MED12Q93074 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms