Protein–RNA interactions for Protein: Q92994

BRF1, Transcription factor IIIB 90 kDa subunit, humanhuman

Predictions only

Length 677 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRF1Q92994 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC30.65■■■□□ 2.5
BRF1Q92994 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
BRF1Q92994 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC30.65■■■□□ 2.5
BRF1Q92994 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
BRF1Q92994 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC30.64■■■□□ 2.5
BRF1Q92994 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
BRF1Q92994 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC30.64■■■□□ 2.5
BRF1Q92994 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC30.63■■■□□ 2.49
BRF1Q92994 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
BRF1Q92994 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC30.62■■■□□ 2.49
BRF1Q92994 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
BRF1Q92994 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC30.61■■■□□ 2.49
BRF1Q92994 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC30.6■■■□□ 2.49
BRF1Q92994 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC30.59■■■□□ 2.49
BRF1Q92994 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
BRF1Q92994 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
BRF1Q92994 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.58■■■□□ 2.49
BRF1Q92994 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
BRF1Q92994 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
BRF1Q92994 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
BRF1Q92994 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
BRF1Q92994 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
BRF1Q92994 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
BRF1Q92994 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
BRF1Q92994 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC30.55■■■□□ 2.48
BRF1Q92994 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
BRF1Q92994 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
BRF1Q92994 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC30.54■■■□□ 2.48
BRF1Q92994 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.54■■■□□ 2.48
BRF1Q92994 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC30.53■■■□□ 2.48
BRF1Q92994 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
BRF1Q92994 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.48
BRF1Q92994 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC30.51■■■□□ 2.47
BRF1Q92994 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
BRF1Q92994 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.51■■■□□ 2.47
BRF1Q92994 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
BRF1Q92994 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
BRF1Q92994 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
BRF1Q92994 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
BRF1Q92994 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.47■■■□□ 2.47
BRF1Q92994 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
BRF1Q92994 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.46■■■□□ 2.47
BRF1Q92994 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.46■■■□□ 2.47
BRF1Q92994 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
BRF1Q92994 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.45■■■□□ 2.47
BRF1Q92994 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
BRF1Q92994 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
BRF1Q92994 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC30.44■■■□□ 2.46
BRF1Q92994 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC30.42■■■□□ 2.46
BRF1Q92994 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC30.42■■■□□ 2.46
BRF1Q92994 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC30.4■■■□□ 2.46
BRF1Q92994 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
BRF1Q92994 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.4■■■□□ 2.46
BRF1Q92994 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
BRF1Q92994 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC30.39■■■□□ 2.46
BRF1Q92994 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC30.39■■■□□ 2.46
BRF1Q92994 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
BRF1Q92994 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
BRF1Q92994 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC30.38■■■□□ 2.45
BRF1Q92994 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC30.38■■■□□ 2.45
BRF1Q92994 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC30.37■■■□□ 2.45
BRF1Q92994 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
BRF1Q92994 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC30.36■■■□□ 2.45
BRF1Q92994 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC30.35■■■□□ 2.45
BRF1Q92994 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
BRF1Q92994 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
BRF1Q92994 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
BRF1Q92994 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
BRF1Q92994 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.34■■■□□ 2.45
BRF1Q92994 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
BRF1Q92994 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
BRF1Q92994 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
BRF1Q92994 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC30.33■■■□□ 2.45
BRF1Q92994 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.33■■■□□ 2.45
BRF1Q92994 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
BRF1Q92994 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
BRF1Q92994 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
BRF1Q92994 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC30.32■■■□□ 2.44
BRF1Q92994 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
BRF1Q92994 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
BRF1Q92994 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
BRF1Q92994 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC30.31■■■□□ 2.44
BRF1Q92994 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
BRF1Q92994 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC30.31■■■□□ 2.44
BRF1Q92994 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
BRF1Q92994 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
BRF1Q92994 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.31■■■□□ 2.44
BRF1Q92994 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
BRF1Q92994 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
BRF1Q92994 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
BRF1Q92994 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
BRF1Q92994 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC30.29■■■□□ 2.44
BRF1Q92994 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC30.29■■■□□ 2.44
BRF1Q92994 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
BRF1Q92994 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
BRF1Q92994 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC30.28■■■□□ 2.44
BRF1Q92994 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC30.27■■■□□ 2.44
BRF1Q92994 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
BRF1Q92994 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
BRF1Q92994 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC30.26■■■□□ 2.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.1 ms