Protein–RNA interactions for Protein: Q92902

HPS1, Hermansky-Pudlak syndrome 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 700 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPS1Q92902 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HPS1Q92902 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HPS1Q92902 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
HPS1Q92902 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
HPS1Q92902 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HPS1Q92902 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HPS1Q92902 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HPS1Q92902 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
HPS1Q92902 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
HPS1Q92902 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
HPS1Q92902 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HPS1Q92902 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HPS1Q92902 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HPS1Q92902 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
HPS1Q92902 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
HPS1Q92902 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HPS1Q92902 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HPS1Q92902 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
HPS1Q92902 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
HPS1Q92902 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
HPS1Q92902 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HPS1Q92902 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
HPS1Q92902 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
HPS1Q92902 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HPS1Q92902 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
HPS1Q92902 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HPS1Q92902 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
HPS1Q92902 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
HPS1Q92902 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
HPS1Q92902 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
HPS1Q92902 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
HPS1Q92902 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
HPS1Q92902 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
HPS1Q92902 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HPS1Q92902 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
HPS1Q92902 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HPS1Q92902 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HPS1Q92902 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HPS1Q92902 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HPS1Q92902 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
HPS1Q92902 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
HPS1Q92902 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HPS1Q92902 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HPS1Q92902 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HPS1Q92902 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HPS1Q92902 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
HPS1Q92902 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
HPS1Q92902 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HPS1Q92902 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
HPS1Q92902 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
HPS1Q92902 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
HPS1Q92902 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
HPS1Q92902 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
HPS1Q92902 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HPS1Q92902 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HPS1Q92902 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HPS1Q92902 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HPS1Q92902 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HPS1Q92902 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HPS1Q92902 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HPS1Q92902 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HPS1Q92902 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HPS1Q92902 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HPS1Q92902 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HPS1Q92902 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
HPS1Q92902 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HPS1Q92902 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HPS1Q92902 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HPS1Q92902 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HPS1Q92902 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HPS1Q92902 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HPS1Q92902 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HPS1Q92902 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HPS1Q92902 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
HPS1Q92902 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
HPS1Q92902 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
HPS1Q92902 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
HPS1Q92902 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
HPS1Q92902 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
HPS1Q92902 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HPS1Q92902 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HPS1Q92902 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
HPS1Q92902 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HPS1Q92902 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
HPS1Q92902 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
HPS1Q92902 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
HPS1Q92902 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HPS1Q92902 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
HPS1Q92902 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HPS1Q92902 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HPS1Q92902 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HPS1Q92902 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HPS1Q92902 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HPS1Q92902 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
HPS1Q92902 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HPS1Q92902 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
HPS1Q92902 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
HPS1Q92902 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HPS1Q92902 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HPS1Q92902 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.9 ms