Protein–RNA interactions for Protein: Q92750

TAF4B, Transcription initiation factor TFIID subunit 4B, humanhuman

Predictions only

Length 862 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF4BQ92750 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
TAF4BQ92750 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
TAF4BQ92750 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
TAF4BQ92750 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
TAF4BQ92750 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
TAF4BQ92750 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
TAF4BQ92750 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
TAF4BQ92750 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
TAF4BQ92750 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
TAF4BQ92750 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
TAF4BQ92750 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
TAF4BQ92750 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
TAF4BQ92750 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
TAF4BQ92750 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
TAF4BQ92750 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
TAF4BQ92750 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
TAF4BQ92750 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
TAF4BQ92750 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
TAF4BQ92750 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
TAF4BQ92750 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
TAF4BQ92750 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC28.13■■■□□ 2.09
TAF4BQ92750 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
TAF4BQ92750 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
TAF4BQ92750 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC28.13■■■□□ 2.09
TAF4BQ92750 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
TAF4BQ92750 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
TAF4BQ92750 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
TAF4BQ92750 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
TAF4BQ92750 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
TAF4BQ92750 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
TAF4BQ92750 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
TAF4BQ92750 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
TAF4BQ92750 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
TAF4BQ92750 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
TAF4BQ92750 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
TAF4BQ92750 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
TAF4BQ92750 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
TAF4BQ92750 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
TAF4BQ92750 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
TAF4BQ92750 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
TAF4BQ92750 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
TAF4BQ92750 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
TAF4BQ92750 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
TAF4BQ92750 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
TAF4BQ92750 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
TAF4BQ92750 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
TAF4BQ92750 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
TAF4BQ92750 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
TAF4BQ92750 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
TAF4BQ92750 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
TAF4BQ92750 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
TAF4BQ92750 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
TAF4BQ92750 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
TAF4BQ92750 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
TAF4BQ92750 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
TAF4BQ92750 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC28.02■■■□□ 2.08
TAF4BQ92750 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
TAF4BQ92750 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
TAF4BQ92750 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
TAF4BQ92750 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
TAF4BQ92750 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC28■■■□□ 2.07
TAF4BQ92750 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
TAF4BQ92750 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
TAF4BQ92750 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
TAF4BQ92750 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
TAF4BQ92750 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
TAF4BQ92750 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
TAF4BQ92750 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
TAF4BQ92750 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
TAF4BQ92750 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
TAF4BQ92750 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
TAF4BQ92750 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
TAF4BQ92750 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
TAF4BQ92750 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
TAF4BQ92750 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
TAF4BQ92750 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC27.94■■■□□ 2.06
TAF4BQ92750 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
TAF4BQ92750 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
TAF4BQ92750 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
TAF4BQ92750 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
TAF4BQ92750 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
TAF4BQ92750 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
TAF4BQ92750 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
TAF4BQ92750 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
TAF4BQ92750 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
TAF4BQ92750 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
TAF4BQ92750 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
TAF4BQ92750 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
TAF4BQ92750 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
TAF4BQ92750 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.05
TAF4BQ92750 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
TAF4BQ92750 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
TAF4BQ92750 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
TAF4BQ92750 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
TAF4BQ92750 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
TAF4BQ92750 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC27.87■■■□□ 2.05
TAF4BQ92750 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
TAF4BQ92750 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
TAF4BQ92750 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
TAF4BQ92750 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.2 ms