Protein–RNA interactions for Protein: Q92620

DHX38, Pre-mRNA-splicing factor ATP-dependent RNA helicase PRP16, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DHX38Q92620 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
DHX38Q92620 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
DHX38Q92620 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
DHX38Q92620 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
DHX38Q92620 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
DHX38Q92620 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
DHX38Q92620 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
DHX38Q92620 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
DHX38Q92620 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
DHX38Q92620 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC29.08■■■□□ 2.25
DHX38Q92620 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
DHX38Q92620 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
DHX38Q92620 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
DHX38Q92620 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
DHX38Q92620 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
DHX38Q92620 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
DHX38Q92620 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
DHX38Q92620 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
DHX38Q92620 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
DHX38Q92620 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
DHX38Q92620 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
DHX38Q92620 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
DHX38Q92620 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
DHX38Q92620 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
DHX38Q92620 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
DHX38Q92620 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
DHX38Q92620 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
DHX38Q92620 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
DHX38Q92620 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
DHX38Q92620 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
DHX38Q92620 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
DHX38Q92620 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC29■■■□□ 2.23
DHX38Q92620 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
DHX38Q92620 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
DHX38Q92620 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
DHX38Q92620 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
DHX38Q92620 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
DHX38Q92620 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
DHX38Q92620 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
DHX38Q92620 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
DHX38Q92620 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
DHX38Q92620 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC28.95■■■□□ 2.22
DHX38Q92620 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
DHX38Q92620 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
DHX38Q92620 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
DHX38Q92620 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
DHX38Q92620 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
DHX38Q92620 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
DHX38Q92620 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
DHX38Q92620 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
DHX38Q92620 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
DHX38Q92620 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
DHX38Q92620 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
DHX38Q92620 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
DHX38Q92620 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
DHX38Q92620 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC28.92■■■□□ 2.22
DHX38Q92620 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
DHX38Q92620 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
DHX38Q92620 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
DHX38Q92620 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
DHX38Q92620 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
DHX38Q92620 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
DHX38Q92620 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.22
DHX38Q92620 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
DHX38Q92620 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
DHX38Q92620 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
DHX38Q92620 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
DHX38Q92620 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
DHX38Q92620 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
DHX38Q92620 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
DHX38Q92620 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
DHX38Q92620 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC28.89■■■□□ 2.21
DHX38Q92620 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
DHX38Q92620 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
DHX38Q92620 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
DHX38Q92620 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
DHX38Q92620 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
DHX38Q92620 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
DHX38Q92620 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
DHX38Q92620 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
DHX38Q92620 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC28.85■■■□□ 2.21
DHX38Q92620 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
DHX38Q92620 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
DHX38Q92620 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
DHX38Q92620 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
DHX38Q92620 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
DHX38Q92620 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
DHX38Q92620 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
DHX38Q92620 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
DHX38Q92620 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
DHX38Q92620 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
DHX38Q92620 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
DHX38Q92620 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
DHX38Q92620 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
DHX38Q92620 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
DHX38Q92620 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
DHX38Q92620 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
DHX38Q92620 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
DHX38Q92620 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
DHX38Q92620 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.5 ms