Protein–RNA interactions for Protein: Q92600

CNOT9, CCR4-NOT transcription complex subunit 9, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNOT9Q92600 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
CNOT9Q92600 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CNOT9Q92600 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CNOT9Q92600 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CNOT9Q92600 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
CNOT9Q92600 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CNOT9Q92600 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CNOT9Q92600 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CNOT9Q92600 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CNOT9Q92600 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CNOT9Q92600 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
CNOT9Q92600 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CNOT9Q92600 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CNOT9Q92600 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CNOT9Q92600 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CNOT9Q92600 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CNOT9Q92600 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CNOT9Q92600 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CNOT9Q92600 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CNOT9Q92600 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CNOT9Q92600 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CNOT9Q92600 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CNOT9Q92600 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CNOT9Q92600 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CNOT9Q92600 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CNOT9Q92600 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CNOT9Q92600 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
CNOT9Q92600 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CNOT9Q92600 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CNOT9Q92600 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CNOT9Q92600 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CNOT9Q92600 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CNOT9Q92600 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CNOT9Q92600 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
CNOT9Q92600 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CNOT9Q92600 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CNOT9Q92600 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CNOT9Q92600 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CNOT9Q92600 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CNOT9Q92600 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CNOT9Q92600 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CNOT9Q92600 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CNOT9Q92600 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CNOT9Q92600 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CNOT9Q92600 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CNOT9Q92600 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CNOT9Q92600 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CNOT9Q92600 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CNOT9Q92600 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CNOT9Q92600 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CNOT9Q92600 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
CNOT9Q92600 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
CNOT9Q92600 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CNOT9Q92600 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
CNOT9Q92600 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CNOT9Q92600 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
CNOT9Q92600 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CNOT9Q92600 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CNOT9Q92600 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CNOT9Q92600 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CNOT9Q92600 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CNOT9Q92600 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CNOT9Q92600 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CNOT9Q92600 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CNOT9Q92600 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CNOT9Q92600 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
CNOT9Q92600 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CNOT9Q92600 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CNOT9Q92600 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CNOT9Q92600 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CNOT9Q92600 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CNOT9Q92600 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CNOT9Q92600 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
CNOT9Q92600 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
CNOT9Q92600 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CNOT9Q92600 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CNOT9Q92600 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CNOT9Q92600 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CNOT9Q92600 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CNOT9Q92600 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CNOT9Q92600 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CNOT9Q92600 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CNOT9Q92600 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CNOT9Q92600 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CNOT9Q92600 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CNOT9Q92600 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CNOT9Q92600 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CNOT9Q92600 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CNOT9Q92600 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CNOT9Q92600 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CNOT9Q92600 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CNOT9Q92600 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CNOT9Q92600 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CNOT9Q92600 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CNOT9Q92600 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CNOT9Q92600 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CNOT9Q92600 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CNOT9Q92600 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CNOT9Q92600 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CNOT9Q92600 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.9 ms