Protein–RNA interactions for Protein: Q92570

NR4A3, Nuclear receptor subfamily 4 group A member 3, humanhuman

Predictions only

Length 626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR4A3Q92570 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NR4A3Q92570 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NR4A3Q92570 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NR4A3Q92570 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NR4A3Q92570 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NR4A3Q92570 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NR4A3Q92570 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
NR4A3Q92570 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NR4A3Q92570 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NR4A3Q92570 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NR4A3Q92570 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NR4A3Q92570 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NR4A3Q92570 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NR4A3Q92570 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NR4A3Q92570 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
NR4A3Q92570 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NR4A3Q92570 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NR4A3Q92570 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
NR4A3Q92570 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
NR4A3Q92570 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NR4A3Q92570 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
NR4A3Q92570 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NR4A3Q92570 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NR4A3Q92570 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NR4A3Q92570 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NR4A3Q92570 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NR4A3Q92570 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NR4A3Q92570 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NR4A3Q92570 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NR4A3Q92570 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NR4A3Q92570 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NR4A3Q92570 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NR4A3Q92570 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NR4A3Q92570 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
NR4A3Q92570 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NR4A3Q92570 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NR4A3Q92570 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NR4A3Q92570 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NR4A3Q92570 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NR4A3Q92570 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NR4A3Q92570 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NR4A3Q92570 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NR4A3Q92570 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NR4A3Q92570 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NR4A3Q92570 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NR4A3Q92570 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NR4A3Q92570 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NR4A3Q92570 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NR4A3Q92570 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NR4A3Q92570 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NR4A3Q92570 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NR4A3Q92570 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NR4A3Q92570 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NR4A3Q92570 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NR4A3Q92570 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NR4A3Q92570 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NR4A3Q92570 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NR4A3Q92570 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NR4A3Q92570 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
NR4A3Q92570 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
NR4A3Q92570 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NR4A3Q92570 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NR4A3Q92570 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NR4A3Q92570 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
NR4A3Q92570 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NR4A3Q92570 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NR4A3Q92570 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NR4A3Q92570 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NR4A3Q92570 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NR4A3Q92570 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NR4A3Q92570 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NR4A3Q92570 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NR4A3Q92570 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NR4A3Q92570 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NR4A3Q92570 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NR4A3Q92570 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NR4A3Q92570 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NR4A3Q92570 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NR4A3Q92570 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NR4A3Q92570 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
NR4A3Q92570 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NR4A3Q92570 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
NR4A3Q92570 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
NR4A3Q92570 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
NR4A3Q92570 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NR4A3Q92570 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NR4A3Q92570 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NR4A3Q92570 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NR4A3Q92570 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NR4A3Q92570 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NR4A3Q92570 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NR4A3Q92570 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
NR4A3Q92570 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NR4A3Q92570 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NR4A3Q92570 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NR4A3Q92570 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
NR4A3Q92570 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
NR4A3Q92570 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
NR4A3Q92570 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NR4A3Q92570 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.9 ms