Protein–RNA interactions for Protein: Q92546

RGP1, RAB6A-GEF complex partner protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGP1Q92546 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RGP1Q92546 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RGP1Q92546 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RGP1Q92546 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RGP1Q92546 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RGP1Q92546 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RGP1Q92546 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RGP1Q92546 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RGP1Q92546 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RGP1Q92546 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RGP1Q92546 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RGP1Q92546 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RGP1Q92546 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RGP1Q92546 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RGP1Q92546 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RGP1Q92546 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RGP1Q92546 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RGP1Q92546 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RGP1Q92546 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RGP1Q92546 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RGP1Q92546 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RGP1Q92546 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RGP1Q92546 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RGP1Q92546 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RGP1Q92546 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RGP1Q92546 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RGP1Q92546 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RGP1Q92546 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RGP1Q92546 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RGP1Q92546 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RGP1Q92546 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RGP1Q92546 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
RGP1Q92546 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RGP1Q92546 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RGP1Q92546 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
RGP1Q92546 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
RGP1Q92546 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RGP1Q92546 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RGP1Q92546 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RGP1Q92546 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RGP1Q92546 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
RGP1Q92546 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RGP1Q92546 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RGP1Q92546 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RGP1Q92546 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RGP1Q92546 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RGP1Q92546 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RGP1Q92546 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RGP1Q92546 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RGP1Q92546 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RGP1Q92546 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RGP1Q92546 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RGP1Q92546 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RGP1Q92546 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RGP1Q92546 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RGP1Q92546 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RGP1Q92546 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RGP1Q92546 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RGP1Q92546 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RGP1Q92546 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RGP1Q92546 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RGP1Q92546 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RGP1Q92546 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RGP1Q92546 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RGP1Q92546 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RGP1Q92546 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
RGP1Q92546 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RGP1Q92546 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RGP1Q92546 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RGP1Q92546 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RGP1Q92546 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RGP1Q92546 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RGP1Q92546 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RGP1Q92546 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RGP1Q92546 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
RGP1Q92546 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RGP1Q92546 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RGP1Q92546 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RGP1Q92546 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RGP1Q92546 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RGP1Q92546 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RGP1Q92546 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RGP1Q92546 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RGP1Q92546 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RGP1Q92546 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RGP1Q92546 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RGP1Q92546 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RGP1Q92546 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RGP1Q92546 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RGP1Q92546 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RGP1Q92546 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RGP1Q92546 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RGP1Q92546 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RGP1Q92546 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
RGP1Q92546 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RGP1Q92546 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RGP1Q92546 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RGP1Q92546 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RGP1Q92546 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RGP1Q92546 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms