Protein–RNA interactions for Protein: Q924W9

Lmo1, Rhombotin-1, mousemouse

Predictions only

Length 156 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmo1Q924W9 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Lmo1Q924W9 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Lmo1Q924W9 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Lmo1Q924W9 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Lmo1Q924W9 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Lmo1Q924W9 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Lmo1Q924W9 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Lmo1Q924W9 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Lmo1Q924W9 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Lmo1Q924W9 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lmo1Q924W9 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lmo1Q924W9 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lmo1Q924W9 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lmo1Q924W9 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Lmo1Q924W9 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Lmo1Q924W9 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Lmo1Q924W9 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Lmo1Q924W9 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Lmo1Q924W9 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Lmo1Q924W9 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Lmo1Q924W9 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Lmo1Q924W9 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Lmo1Q924W9 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Lmo1Q924W9 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Lmo1Q924W9 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Lmo1Q924W9 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Lmo1Q924W9 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Lmo1Q924W9 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Lmo1Q924W9 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Lmo1Q924W9 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Lmo1Q924W9 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Lmo1Q924W9 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Lmo1Q924W9 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Lmo1Q924W9 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Lmo1Q924W9 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Lmo1Q924W9 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Lmo1Q924W9 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Lmo1Q924W9 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Lmo1Q924W9 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Lmo1Q924W9 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
Lmo1Q924W9 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Lmo1Q924W9 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Lmo1Q924W9 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Lmo1Q924W9 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Lmo1Q924W9 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Lmo1Q924W9 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Lmo1Q924W9 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Lmo1Q924W9 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Lmo1Q924W9 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Lmo1Q924W9 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Lmo1Q924W9 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Lmo1Q924W9 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Lmo1Q924W9 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Lmo1Q924W9 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Lmo1Q924W9 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Lmo1Q924W9 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Lmo1Q924W9 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Lmo1Q924W9 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Lmo1Q924W9 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Lmo1Q924W9 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Lmo1Q924W9 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Lmo1Q924W9 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Lmo1Q924W9 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Lmo1Q924W9 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Lmo1Q924W9 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Lmo1Q924W9 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Lmo1Q924W9 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
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Lmo1Q924W9 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Lmo1Q924W9 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Lmo1Q924W9 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Lmo1Q924W9 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Lmo1Q924W9 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Lmo1Q924W9 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Lmo1Q924W9 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Lmo1Q924W9 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Lmo1Q924W9 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Lmo1Q924W9 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Lmo1Q924W9 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Lmo1Q924W9 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Lmo1Q924W9 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Lmo1Q924W9 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Lmo1Q924W9 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Lmo1Q924W9 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Lmo1Q924W9 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Lmo1Q924W9 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Lmo1Q924W9 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Lmo1Q924W9 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Lmo1Q924W9 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Lmo1Q924W9 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Lmo1Q924W9 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Lmo1Q924W9 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Lmo1Q924W9 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Lmo1Q924W9 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Lmo1Q924W9 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Lmo1Q924W9 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Lmo1Q924W9 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Lmo1Q924W9 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
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