Protein–RNA interactions for Protein: Q922J3

Clip1, CAP-Gly domain-containing linker protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clip1Q922J3 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.53■■■■□ 3.76
Clip1Q922J3 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.53■■■■□ 3.76
Clip1Q922J3 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.53■■■■□ 3.76
Clip1Q922J3 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC38.53■■■■□ 3.76
Clip1Q922J3 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.53■■■■□ 3.76
Clip1Q922J3 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC38.51■■■■□ 3.76
Clip1Q922J3 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.5■■■■□ 3.75
Clip1Q922J3 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC38.49■■■■□ 3.75
Clip1Q922J3 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC38.49■■■■□ 3.75
Clip1Q922J3 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.48■■■■□ 3.75
Clip1Q922J3 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC38.48■■■■□ 3.75
Clip1Q922J3 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC38.47■■■■□ 3.75
Clip1Q922J3 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC38.47■■■■□ 3.75
Clip1Q922J3 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.45■■■■□ 3.75
Clip1Q922J3 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC38.44■■■■□ 3.74
Clip1Q922J3 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.44■■■■□ 3.74
Clip1Q922J3 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC38.43■■■■□ 3.74
Clip1Q922J3 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC38.42■■■■□ 3.74
Clip1Q922J3 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.41■■■■□ 3.74
Clip1Q922J3 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC38.41■■■■□ 3.74
Clip1Q922J3 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.4■■■■□ 3.74
Clip1Q922J3 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC38.4■■■■□ 3.74
Clip1Q922J3 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC38.39■■■■□ 3.74
Clip1Q922J3 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC38.38■■■■□ 3.73
Clip1Q922J3 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.38■■■■□ 3.73
Clip1Q922J3 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.37■■■■□ 3.73
Clip1Q922J3 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.37■■■■□ 3.73
Clip1Q922J3 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.37■■■■□ 3.73
Clip1Q922J3 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.36■■■■□ 3.73
Clip1Q922J3 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.36■■■■□ 3.73
Clip1Q922J3 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC38.36■■■■□ 3.73
Clip1Q922J3 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC38.36■■■■□ 3.73
Clip1Q922J3 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.35■■■■□ 3.73
Clip1Q922J3 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC38.35■■■■□ 3.73
Clip1Q922J3 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC38.35■■■■□ 3.73
Clip1Q922J3 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.35■■■■□ 3.73
Clip1Q922J3 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.35■■■■□ 3.73
Clip1Q922J3 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.34■■■■□ 3.73
Clip1Q922J3 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.32■■■■□ 3.72
Clip1Q922J3 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC38.31■■■■□ 3.72
Clip1Q922J3 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.31■■■■□ 3.72
Clip1Q922J3 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.29■■■■□ 3.72
Clip1Q922J3 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC38.29■■■■□ 3.72
Clip1Q922J3 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC38.27■■■■□ 3.72
Clip1Q922J3 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC38.27■■■■□ 3.72
Clip1Q922J3 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.26■■■■□ 3.71
Clip1Q922J3 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.25■■■■□ 3.71
Clip1Q922J3 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.25■■■■□ 3.71
Clip1Q922J3 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.25■■■■□ 3.71
Clip1Q922J3 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.25■■■■□ 3.71
Clip1Q922J3 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.24■■■■□ 3.71
Clip1Q922J3 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.22■■■■□ 3.71
Clip1Q922J3 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.22■■■■□ 3.71
Clip1Q922J3 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC38.22■■■■□ 3.71
Clip1Q922J3 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.2■■■■□ 3.71
Clip1Q922J3 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.19■■■■□ 3.7
Clip1Q922J3 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC38.18■■■■□ 3.7
Clip1Q922J3 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC38.18■■■■□ 3.7
Clip1Q922J3 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.18■■■■□ 3.7
Clip1Q922J3 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.17■■■■□ 3.7
Clip1Q922J3 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.16■■■■□ 3.7
Clip1Q922J3 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC38.16■■■■□ 3.7
Clip1Q922J3 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.15■■■■□ 3.7
Clip1Q922J3 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC38.15■■■■□ 3.7
Clip1Q922J3 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC38.15■■■■□ 3.7
Clip1Q922J3 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC38.12■■■■□ 3.69
Clip1Q922J3 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC38.11■■■■□ 3.69
Clip1Q922J3 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.09■■■■□ 3.69
Clip1Q922J3 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC38.08■■■■□ 3.69
Clip1Q922J3 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.08■■■■□ 3.69
Clip1Q922J3 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC38.07■■■■□ 3.69
Clip1Q922J3 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC38.07■■■■□ 3.69
Clip1Q922J3 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.07■■■■□ 3.68
Clip1Q922J3 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC38.06■■■■□ 3.68
Clip1Q922J3 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC38.06■■■■□ 3.68
Clip1Q922J3 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.06■■■■□ 3.68
Clip1Q922J3 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.06■■■■□ 3.68
Clip1Q922J3 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.06■■■■□ 3.68
Clip1Q922J3 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC38.05■■■■□ 3.68
Clip1Q922J3 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC38.05■■■■□ 3.68
Clip1Q922J3 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.02■■■■□ 3.68
Clip1Q922J3 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.02■■■■□ 3.68
Clip1Q922J3 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.01■■■■□ 3.68
Clip1Q922J3 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.98■■■■□ 3.67
Clip1Q922J3 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.97■■■■□ 3.67
Clip1Q922J3 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC37.96■■■■□ 3.67
Clip1Q922J3 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC37.95■■■■□ 3.67
Clip1Q922J3 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.94■■■■□ 3.66
Clip1Q922J3 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.94■■■■□ 3.66
Clip1Q922J3 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC37.93■■■■□ 3.66
Clip1Q922J3 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.93■■■■□ 3.66
Clip1Q922J3 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC37.93■■■■□ 3.66
Clip1Q922J3 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC37.92■■■■□ 3.66
Clip1Q922J3 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.91■■■■□ 3.66
Clip1Q922J3 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.9■■■■□ 3.66
Clip1Q922J3 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC37.9■■■■□ 3.66
Clip1Q922J3 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.9■■■■□ 3.66
Clip1Q922J3 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.9■■■■□ 3.66
Clip1Q922J3 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.9■■■■□ 3.66
Clip1Q922J3 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC37.9■■■■□ 3.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms