Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZU9

Grin3b, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 3B, mousemouse

Predictions only

Length 1,003 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin3bQ91ZU9 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Grin3bQ91ZU9 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
Grin3bQ91ZU9 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Grin3bQ91ZU9 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Grin3bQ91ZU9 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Grin3bQ91ZU9 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Grin3bQ91ZU9 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Grin3bQ91ZU9 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Grin3bQ91ZU9 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Grin3bQ91ZU9 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Grin3bQ91ZU9 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Grin3bQ91ZU9 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Grin3bQ91ZU9 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Grin3bQ91ZU9 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Grin3bQ91ZU9 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Grin3bQ91ZU9 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Grin3bQ91ZU9 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Grin3bQ91ZU9 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Grin3bQ91ZU9 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Grin3bQ91ZU9 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
Grin3bQ91ZU9 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Grin3bQ91ZU9 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Grin3bQ91ZU9 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Grin3bQ91ZU9 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Grin3bQ91ZU9 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Grin3bQ91ZU9 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Grin3bQ91ZU9 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Grin3bQ91ZU9 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Grin3bQ91ZU9 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Grin3bQ91ZU9 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Grin3bQ91ZU9 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Grin3bQ91ZU9 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
Grin3bQ91ZU9 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Grin3bQ91ZU9 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Grin3bQ91ZU9 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Grin3bQ91ZU9 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Grin3bQ91ZU9 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Grin3bQ91ZU9 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Grin3bQ91ZU9 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Grin3bQ91ZU9 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Grin3bQ91ZU9 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Grin3bQ91ZU9 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Grin3bQ91ZU9 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Grin3bQ91ZU9 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Grin3bQ91ZU9 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Grin3bQ91ZU9 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Grin3bQ91ZU9 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Grin3bQ91ZU9 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Grin3bQ91ZU9 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Grin3bQ91ZU9 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
Grin3bQ91ZU9 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Grin3bQ91ZU9 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Grin3bQ91ZU9 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Grin3bQ91ZU9 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Grin3bQ91ZU9 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Grin3bQ91ZU9 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Grin3bQ91ZU9 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Grin3bQ91ZU9 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Grin3bQ91ZU9 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Grin3bQ91ZU9 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Grin3bQ91ZU9 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Grin3bQ91ZU9 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Grin3bQ91ZU9 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Grin3bQ91ZU9 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Grin3bQ91ZU9 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Grin3bQ91ZU9 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Grin3bQ91ZU9 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
Grin3bQ91ZU9 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Grin3bQ91ZU9 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Grin3bQ91ZU9 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Grin3bQ91ZU9 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Grin3bQ91ZU9 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Grin3bQ91ZU9 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Grin3bQ91ZU9 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Grin3bQ91ZU9 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Grin3bQ91ZU9 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Grin3bQ91ZU9 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Grin3bQ91ZU9 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Grin3bQ91ZU9 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Grin3bQ91ZU9 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Grin3bQ91ZU9 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Grin3bQ91ZU9 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Grin3bQ91ZU9 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Grin3bQ91ZU9 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Grin3bQ91ZU9 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Grin3bQ91ZU9 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Grin3bQ91ZU9 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Grin3bQ91ZU9 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Grin3bQ91ZU9 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Grin3bQ91ZU9 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Grin3bQ91ZU9 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Grin3bQ91ZU9 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Grin3bQ91ZU9 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Grin3bQ91ZU9 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Grin3bQ91ZU9 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Grin3bQ91ZU9 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Grin3bQ91ZU9 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Grin3bQ91ZU9 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Grin3bQ91ZU9 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Grin3bQ91ZU9 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms